%0 Journal Article
%T CARACTERIZACI車N GENOT赤PICA DE AISLAMIENTOS COLOMBIANOS DEL POTATO MOP-TOP VIRUS (PMTV, POMOVIRUS) GENOTYPIC CHARACTERIZATION OF COLOMBIAN ISOLATES OF POTATO MOP-TOP VIRUS (PMTV, POMOVIRUS)
%A Jos谷 F. Gil
%A Pablo A. Guti谷rrez
%A Jos谷 M. Cotes
%A Elena P. Gonz芍lez
%J Actualidades Biol車gicas
%D 2011
%I Universidad de Antioquia
%X Recientemente se detect車 en Colombia la presencia del virus mop-top de la papa (PMTV, Pomovirus), transmitido por zoosporas del protozoo Spongospora subterranea f. sp. subterranea, agente causal de la sarna polvosa de la papa. Esta investigaci車n se plante車 con el fin de evaluar las caracter赤sticas genot赤picas de las cepas virales del PMTV obtenidas a partir de 20 muestras de suelos de cultivos de papa de los departamentos de Antioquia, Boyac芍, Cundinamarca y Nari o. Para esto, se amplificaron mediante RT-PCR las regiones parciales que codifican para los genes de la c芍pside (CP) y del segundo gen del triple bloque de genes (TGB2), secuenci芍ndose y compar芍ndose con las secuencias de este virus depositadas en las bases de datos moleculares. Adicionalmente, se seleccionaron dos cepas del virus para aumentar el cubrimiento de las secuencias de los segmentos dos y tres (ARN 2 y ARN 3) del genoma viral. Los resultados reconfirmaron la presencia del virus PMTV en Colombia, detect芍ndose dos variantes principales (I y II), una de ellas correspondiente al genotipo distribuido mundialmente (I); mientras que la otra variante (II) representa aislamientos virales de PMTV no registrados hasta ahora en otros pa赤ses del mundo. Se espera que la informaci車n generada en esta investigaci車n sea considerada en los programas de certificaci車n de tub谷rculo semilla y del manejo cuarentenario de pat車genos del cultivo de papa en el pa赤s. Potato mop-top virus (PMTV, Pomovirus) was detected recently in Colombia. PMTV is transmitted by zoopores of the protozoan Spongospora subterranean f. sp. subterranea, the causal agent of powdery scab in potato. The goal of this study was to assess the genotypic characteristics of viral strains of PMTV obtained from 20 soil samples of potato crops in the departments of Antioquia, Boyac芍, Cundinamarca, and Nari o. To do so, partial regions of the capsid gene (CP) and the second gen of the Triple Gene Block (TGB2) were amplified using RT-PCR. Amplicons were sequenced and compared with PMTV sequences deposited in molecular databases. In addition, we selected two strains of the virus to increase the coverage of sequencing in segments two and three (RNA 2 and RNA 3) of the viral genome. Our results reconfirmed the presence of PMTV in Colombia, with detection of two variants (I and II). One of them corresponds to the major genotype of PMTV reported worldwide (I); the second variant (II) corresponds to a PMTV strain not detected previously in other countries. We hope that this information will be useful to certification programs of eed tubers and plant qua
%K PMTV
%K RT-PCR
%K secuenciaci車n
%K Spongospora subterranea f. sp. subterranea
%K variantes
%K virus
%K PMTV
%K RNA virus
%K potato virus
%K RT-PCR
%K sequencing
%K Spongospora subterranea f. sp. subterranea
%K variants
%U http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0304-35842011000100005