%0 Journal Article
%T 水稻全基因组R基因鉴定及候选RGA标记开发
%A 汪旭升
%J 科学通报
%D 2005
%I 
%X 用45个已知功能的植物抗病(R)基因序列对粳稻全基因组序列进行搜索,共找出2119个R基因同源序列或类似物(RGA),表明RGA在水稻基因组中成簇存在,呈非随机分布.采用隐马尔柯夫模型(HMM),将这些RGA按其功能域分成了21类.将粳稻的RGA与籼稻的基因组序列进行比较,共找到702个两亚种间等位的RGA,并发现其中有671个(占95.6%)RGA的基因组序列(包括编码区和非编码区)在两亚种间存在长度差异(InDel),表明水稻RGA在两亚种间存在很高的多态性.通过在InDel两侧设计引物并进行e-PCR验证,共开发出402个基于PCR的、表现为共显性的候选RGA标记.这些候选标记在两亚种间的长度差异在1~742bp之间,平均为10.26bp.有关数据均可从我们的网站(http://ibi.zju.edu.cn/RGAs/index.html)上获得.
%K 水稻
%K 抗病基因
%K RGA
%K 多态性
%K 分子标记
%U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=01BA20E8BA813E1908F3698710BBFEFEE816345F465FEBA5&cid=7C7E63796F062382A606A3A9833B8C05&jid=B40D4BA57FF46E45205A09B4DC283152&aid=A6FEB348414586C4&yid=2DD7160C83D0ACED&vid=771152D1ADC1C0EB&iid=708DD6B15D2464E8&sid=126825C4749D880D&eid=4997AFD17F6FADE1&journal_id=0023-074X&journal_name=科学通报&referenced_num=5&reference_num=31