%0 Journal Article %T Research of Algorithm for Finding TFBS Based on Gibbs Sampling
基于吉布斯采样的TFBS识别算法研究 %A HE Cai-Sheng %A DAI Xian-Hua %A XIANG Qian %A WANG Jiang %A DENG Yang-Yang %A DAI Zhi-Ming %A
何彩升 %A 戴宪华 %A 向倩 %A 王江 %A 邓泱泱 %A 戴智明 %J 计算机科学 %D 2007 %I %X 计算机方法识别转录因子结合位点(TFBS,也称“模式”)是目前生物信息学的一个很有吸引性和挑战性的课题。吉布斯采样识别模式的算法本质上是一个启发式搜索方法,容易陷入非全局最优的局部最大值。为此,提出了一种改进的吉布斯采样策略YGMS(Yeast Gibbs Motif Sampler)采识别酿酒酵母共表达基因调控区域转录因子结合位点。在酵母的共调控基因序列的数据集测试中,YGMS比其他几个基于吉布斯采样算法更有效地识别出真实模式序列,在一定程度上提高了算法的性能。 %K 生物信息学 %K 吉布斯采样 %K 转录因子结合位点 %U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=5B3AB970F71A803DEACDC0559115BFCF0A068CD97DD29835&cid=8240383F08CE46C8B05036380D75B607&jid=64A12D73428C8B8DBFB978D04DFEB3C1&aid=E08147070A000BE01BF442A73CA43A43&yid=A732AF04DDA03BB3&vid=339D79302DF62549&iid=0B39A22176CE99FB&sid=4609832E4B5C797B&eid=F1A8654ADB4E656E&journal_id=1002-137X&journal_name=计算机科学&referenced_num=0&reference_num=12