%0 Journal Article %T 黑斑狗鱼部分基因组文库构建和微卫星位点的筛选(英文) %A 王洪哲 %A 殷倩茜 %A 冯志纲 %A 李大宇 %A 孙效文 %A 李 婵 %J 动物学研究 %D 2008 %I Chinese Academy of Sciences %X 采用磁珠富集与放射性杂交相结合的方法开发黑斑狗鱼(Esox reieherti Dybowski)基因组微卫星资源。基因组DNA 经Sau 3AⅠ限制性内切酶消化后,选取400―900 bp的片段进行PCR全基因组扩增,并利用生物素标记的(CA)12、(GA)12 探针进行微卫星片段的富集。将得到的片段与pGEM-T载体连接后转入DH5α大肠杆菌中,然后利用γ-32 P标记的放射性同位素探针进行第二次杂交。结果,共获得微卫星基因组文库1 600个菌,杂交前菌落PCR检测阳性克隆率为90.91%;杂交后得到的阳性克隆为1 300个,占87.25%。从中挑出196个进行测序,192(97.96%)个含有微卫星序列。在得到的微卫星序列中,重复单元除CA/GT、GA/CT 外,还观察到单碱基、四碱基、五碱基重复单元。根据侧翼序列应用引物设计软件Primer Premier 5.0设计引物70对,选择合成32对,通过优化PCR反应条件,结果有28对引物可扩增出清晰可重复的目的条带。本研究旨在对黑斑狗鱼基因组资源的开发利用起到一定的促进作用,并为黑斑狗鱼养殖品系的优化、遗传多样性的检测及遗传图谱的构建等奠定基础。 %K 黑斑狗鱼 %K 微卫星 %K 磁珠富集 %U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=7C502F1A6798ACE1B8C57E291C48C7F1&aid=2D42932E076A18259E2AE36922EF23BB&yid=67289AFF6305E306&vid=771469D9D58C34FF&iid=38B194292C032A66&sid=E2E0FBFE4D7EFB94&eid=10828928EB89AD8E&journal_id=0254-5853&journal_name=动物学研究&referenced_num=0&reference_num=27