%0 Journal Article
%T 甘蓝型油菜中一类AP2/ERF转录因子的克隆和生物信息学分析
%A 庄静
%A 周熙荣
%A 孙超才
%A 管帮超
%A 彭日荷
%A 乔玉山
%A 章镇
%A 高峰
%A 蔡斌
%A 熊爱生
%A 姚泉洪
%J 中国生物工程杂志
%D 2008
%I 
%X AP2/ERF转录因子家族是植物中广泛存在的一类转录因子,AP2/ERF这类转录因子主要参与植物的细胞周期、生长发育以及生物和非生物胁迫相关基因的表达调控.由于拟南芥和油菜同属于芸薹属,具有相似的基因信息,利用油菜UniGene数据库,以拟南芥ERF 转录因子保守序列为探针,通过电子克隆从一个UniGene Cluster中分离得到三个同类的 AP2/ERF转录因子,从cDNA序列、氨基酸序列的相似性、组成成分、理化性质、疏水性/ 亲水性分析、序列比对、进化树、功能域、二级结构、三级结构、无序化特性进行了预测和较为全面的分析.结果显示油菜来源的BnaERF1、BnaERF2和BnaERF3属于AP2/ERF 转录因子的B-2亚族,是亲水性蛋白,在蛋白质的三级结构上与AtERF1相似.蛋白质无序化分析发现,油菜BnaERF1、BnaERF2和BnaERF3无序化程度小于拟南芥AtERF1.设计引物通过PCR和RT-PCR方法分别从甘蓝型双低油菜沪油15幼苗的DNA和cDNA中扩增了上述基因,初步分析BnaERF2没有内含子,BnaERF1和BnaERF3有内含子.另外,通过EST丰度分析显示,该类转录因子的表达最高峰在种子中,其次为花,在芽、茎和分生组织中没有检测出表达的存在.
%K AP2/ERF
%K 转录因子
%K 克隆
%K 生物信息学
%K 甘蓝型油菜
%K 沪油15
%K 甘蓝型油菜
%K 转录因子
%K 克隆
%K 生物信息学分析
%K Analyzing
%K Cloning
%K Brassica
%K napus
%K L
%K Genes
%K 检测
%K 分生组织
%K 种子
%K 表达
%K 内含子
%K 基因
%K 幼苗
%K 沪油
%K 双低油菜
%K 方法
%K 设计
%K 程度
%U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=951380788B355DEA7D75520FA3B199C9&aid=4BE7D7EC33D790151D5356ABC6E6B89E&yid=67289AFF6305E306&vid=D3E34374A0D77D7F&iid=94C357A881DFC066&sid=771469D9D58C34FF&eid=1371F55DA51B6E64&journal_id=1671-8135&journal_name=中国生物工程杂志&referenced_num=0&reference_num=31