%0 Journal Article %T Isolation of microsatellite DNA from endangered tree species Toona ciliata var. pubescens and optimization of SSR reaction system
珍稀濒危树种毛红椿微卫星DNA分离及SSR反应体系优化 %A LIU Jun %A SUN Zhong-xiu %A CHEN Yi-tai %A HE Gui-ping %A WU Tian-lin %A
刘军 %A 孙宗修 %A 陈益泰 %A 何贵平 %A 吴天林 %J 中国生物工程杂志 %D 2006 %I %X 以江西宜丰种源毛红椿为材料,成功提取其基因组DNA。利用改良的链亲和素磁珠法亲和捕捉出毛红椿基因组微卫星DNA片段,并构建了富含微卫星的基因组文库。从构建的基因组文库中随机挑选了63个单克隆进行测序,其中50个单克隆成功测序,含有微卫星的单克隆有18个,并根据测序结果设计并合成SSR引物18对。利用所合成的引物优化SSR反应体系,对影响SSR反应的各个因子进行了探讨。确定了模板DNA最适浓度为30ng;dNTP的最适浓度为0.3mmol/L;0.3μmol/L是引物在反应体系中的最合适浓度。建立了重复性好、稳定性好的SSR反应体系,为下一步进行毛红椿群体遗传结构和遗传变异研究提供了技术支持。 %K Toona ciliata var %K pubescens Microsatellite Streptavitin bead SSR reaction system
毛红椿 %K 微卫星 %K 链亲和素磁珠 %K SSR反应体系 %U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=951380788B355DEA7D75520FA3B199C9&aid=4CAD11B44BD6E7ED&yid=37904DC365DD7266&vid=96C778EE049EE47D&iid=59906B3B2830C2C5&sid=771152D1ADC1C0EB&eid=E514EE58E0E50ECF&journal_id=1671-8135&journal_name=中国生物工程杂志&referenced_num=9&reference_num=16