%0 Journal Article
%T 相邻碱基组分与产生SNP的转换或颠换在植物基因组中的研究
%A 赵辉
%A 李启寨
%A 李俊
%A 曾长青
%A 胡松年
%A 于军
%J 中国科学 生命科学
%D 2006
%I 
%X 碱基替换突变是形成物种多态性和造成生物进化的根本原因之一.近年的研究表明基因组的碱基组分在不同程度上与碱基替换突变的发生相关.以水稻全基因组3611007个SNPs(包括45462个编码区SNPs和242811个内含子区SNPs)和拟南芥全基因组32019个SNPs为研究对象,研究突变位点周围的碱基A&T(A和T)的使用频率和点突变类型的相关性,结果表明水稻和拟南芥全基因组上转换和颠换的比值(Ts/Tv)以及紧邻突变位点(上下游各1个碱基)上A&T碱基的个数负相关.统计了6种SNP的AT2(直接相邻的碱基是A或T的个数)和AT0(直接相邻碱基是C或G的个数),发现水稻和拟南芥都是C/G型SNP的AT2/AT0值最大,说明C/G型SNP可能受直接临近区域上A&T碱基的影响最大.在水稻全基因组SNPs中,A&T碱基影响突变的范围局限在突变位点上下游2个碱基内.拟南芥A&T碱基影响其全基因组SNPs的范围不超过上下游4个碱基.
%K 点突变
%K 单碱基多态性
%K 替换
%K 替换偏差
%K 转换
%K 颠换
%U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=DBE4ECF0864647819971514F9C47DC38&aid=7C264CDBC5CDE777&yid=37904DC365DD7266&vid=933658645952ED9F&iid=CA4FD0336C81A37A&sid=CA4FD0336C81A37A&eid=5D311CA918CA9A03&journal_id=1006-9259&journal_name=中国科学C辑&referenced_num=4&reference_num=31