%0 Journal Article
%T Determination of Blastn Parameters for Predicting Paralogs in Tomato BAC Clones<br>检测番茄BAC序列中paralogs的blastn参数研究
%A GE Jing
%A SONG Chi
%A LU Chen
%A WANG Ying
%A <br>葛静
%A 宋驰
%A 卢辰
%A 王瑛
%J 植物科学学报
%D 2009
%I 
%X 并系同源(paralog)和直系同源(ortholog)是物种进化过程中产生的两种基本的同源序列类型.目前判断ortholog的方法已经基本确立,而paralog的判断却还没有统一的标准.番茄全基因组测序正在进行中,利用GenBank中已有的番茄BAC序列进行一系列不同参数下的比对(blastn),根据比对结果确定了paralog预测的最佳参数,分别是E值为10-40,匹配序列长度为200 bp,序列一致率为80%.这些参数值的确定为以后在番茄BAC序列中进行paralog预测提供了适用的参数.
%K Blastn<br>基因复制
%K 番茄
%K 并系同源(paralog)
%K 直系同源(ortholog)
%U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=9973DE552EA54506F7AABD4780345ED2&aid=F1F86BCB8911C1FEF649948D4B6CA7C8&yid=DE12191FBD62783C&vid=DB817633AA4F79B9&iid=0B39A22176CE99FB&sid=CC0ECB9C52F1B85F&eid=1B64850025D0BBBE&journal_id=1000-470X&journal_name=武汉植物学研究&referenced_num=0&reference_num=21