%0 Journal Article
%T Content and Characteristics of Microsatellites Detected in Expressed Sequence Tag Sequences in Eucalyptus
桉树EST序列中微卫星含量及相关特征
%A 李淑娴
%A 张新叶
%A 王英亚
%A 尹佟明
%J 植物学报
%D 2010
%I
%X 通过对桉树属(Eucalyptus)的10 000条EST序列进行分析, 在其中的1 499条序列上共发现1 775个微卫星重复序列。含有微卫星的EST序列约占序列总数的15%。此外, 还发现桉树EST序列所含微卫星长度的变异速率与重复单元长度呈负相关; 微卫星的丰度与重复单元长度也呈负相关(三碱基重复微卫星除外)。在桉树EST序列中, 重复单元长度为三碱基的微卫星最为丰富。三碱基重复单元微卫星的过度富集可能是由于遗传密码选择所致。在微卫星的丰度及长度变异方面, 桉树EST序列与杨树(Populus trichocarpa)基因组注释的转录序列随重复单元长度的变化呈现出相同的规律, 但桉树EST序列中微卫星频率及三碱基重复微卫星的含量显著偏低, 推测含微卫星的基因表达丰度极有可能低于不含微卫星的基因。通过对发现的所有微卫星位点进行引物设计, 并对设计的引物进行PCR检测, 结果表明所设计的引物具有极高的扩增成功率。
%K
桉树
%K 微卫星重复序列
%K 微卫星丰度
%U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=97AE3D0EBF25E42C466FEF50E492F710&aid=AF8036E0E0C6EB896D60EA8B466D301F&yid=140ECF96957D60B2&vid=94E7F66E6C42FA23&iid=38B194292C032A66&sid=8C27CCA578E52082&eid=23410D0BDB501DF5&journal_id=1674-3466&journal_name=植物学报&referenced_num=1&reference_num=24