%0 Journal Article
%T Nonribosomal peptides synthetases gene clusters and core domain in Pseudoalteromonas sp. NJ631<br>海洋细菌Pseudoalteromonas sp. NJ631中NRPS基因簇及核心模件的发掘
%A Wei Chen
%A Peng Zhu
%A Shan He
%A Haixiao Jin
%A Xiaojun Yan
%A <br>陈威
%A 朱鹏
%A 何山
%A 金海晓
%A 严小军
%J 微生物学报
%D 2012
%I 
%X 摘要:【目的】运用基因组信息发掘技术(Genome Mining)对海洋细菌Pseudoalteromonas sp．NJ631基因组中的非核糖体肽合成酶(Nonribosomal peptides synthetases，NRPSs)基因簇资源及其核心模件进行发掘分析，旨在为Pseudoalteromonas属中非核糖体肽(Nonribosomal peptides，NRPs)的发现提供理论依据和数据支持。【方法】依托第二代测序技术获得的Pseudoalteromonas sp．NJ631基因组序列草图，在分析其次生代谢产物编码基因的基础上，利用NRPS-PKS knowledgebase在线预测软件鉴定潜在的NRPSs基因簇，并对其基因组中的NRPSs核心模件腺苷酰化(Adenylation，A)结构域编码基因信息进行发掘。【结果】在NJ631 基因组序列草图中发现3个典型结构组成的NRPSs基因簇，命名为NGC1、NGC2和NGC3，分别位于scaffold6，9和11。进一步的结构域预测分析表明，3个NRPSs 基因簇均含有3个ORFs，其中NGC1编码7个NRPSs模块;NGC2和NGC3均编码6个NRPSs模块。对A结构域的信息发掘显示NJ631基因组中含有38个A结构域编码基因，特异性选择18种氨基酸底物。【结论】通过运用基因组信息发掘技术对海洋细菌Pseudoalteromonas sp．NJ631全基因组信息进行NRPSs基因簇及核心模件A结构域的发掘分析，结果提示，通常只在放线菌或真菌中发现的NRPSs基因资源也在Pseudoalteromonas属中大量存在。研究结果也为今后Pseudoalteromonas 属中非核糖体肽(Nonribosomal peptides，NRPs)的发现提供理论依据。
%K 关键词:海洋细菌，非核糖体肽合成酶，腺苷酰化结构域，基因组信息发掘
%U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=A3C6BA55AB623B90FA9104CFFC826F3C&aid=4D6BB6A422263A4557B7491B56DD3F35&yid=99E9153A83D4CB11&vid=286FB2D22CF8D013&iid=59906B3B2830C2C5&sid=F41021172F25CDE0&eid=B08191F41006DCF9&journal_id=0001-6209&journal_name=微生物学报&referenced_num=0&reference_num=0