%0 Journal Article
%T Analysis of leader and trailer sequence of genotype III, VIb and VIId Newcastle disease virus determined by modified rapid amplification of cDNA ends (RACE) strategy<br>简化cDNA末端快速扩增技术测定基因III、VIb和VIId型新城疫病毒基因组末端序列及分析
%A Xusheng Qiu
%A Qing Sun
%A Weiwei Wang
%A Li Dong
%A Shuang Wu
%A Shunling Hu
%A Yantao Wu
%A Xiufan Liu
%A <br>仇旭升
%A 孙庆
%A 王伟伟
%A 董丽
%A 吴双
%A 胡顺林
%A 吴艳涛
%A 刘秀梵
%J 微生物学报
%D 2009
%I 
%X 摘要: 【目的】简化cDNA末端快速扩增技术（Rapid amplification of cDNA ends, RACE）流程，测定基因III、VIb和VIId型新城疫病毒（Newcastle disease virus, NDV）基因组两侧末端序列，并对NDV的leader和trailer进行分析。【方法】利用T4 RNA连接酶将特定寡聚核苷酸片段的连接于病毒基因组RNA和cDNA，再利用RT-PCR或PCR方法对病毒基因组的末端进行快速的扩增。【结果】建立一套操作简单、低成本、可重复性高的RACE方法，测定了三种基因型5株NDV 3’末端leader和5’末端trailer序列比对分析。【结论】本实验测定的鹅源VII型毒株JS/7/05/Ch基因组的15,184 nt由一个T变为了C，5’端trailer与3’端leader的连续互补序列由8 nt变为12 nt，而其它4株基因III型和VI型NDV均未发现该突变。通过RNA的二级结构分析，NDV基因组和反向基因组RNA的3’末端形成一个发卡结构。JS/7/05/Ch等3株NDV U→C（T→C）的突变位于发卡环上，不影响二级结构的形成，发卡环的RNA序列突变为3’-UCUC-5’，与基因组3’端发卡环的3’-UCUUA-5’相似，推测可能影响了基因组RNA的复制速度。
%K 关键词:
%K cDNA末端快速扩增技术（Rapid
%K amplification
%K of
%K cDNA
%K ends
%K RACE）
%K 基因III型
%K 基因VIb型
%K 新城疫病毒
%K 基因组3’末端（leader）
%K 基因组5’末端（trailer）
%U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=A3C6BA55AB623B90FA9104CFFC826F3C&aid=AEABDE966A8490FF0E9D3D76FB562DC7&yid=DE12191FBD62783C&vid=2A3781E88AB1776F&iid=DF92D298D3FF1E6E&sid=78AF84DBB4041008&eid=E151839C3C081609&journal_id=0001-6209&journal_name=微生物学报&referenced_num=0&reference_num=0