%0 Journal Article
%T Construction and Analysis of VP3 from a Foot-and-mouth Disease Virus Strain AF72<br>口蹄疫病毒株AF72 VP3的结构模拟与分析
%A CHEN Qi-Wei
%A WANG Yong-Lu
%A ZHANG Yong-Guang
%A PAN Li
%A FANG Yu-Zhen
%A JIANG Shou-Tian
%A LV Jian-Liang
%A ZHOU Peng
%A ZHANG Zhong-Wang
%A ZHANG Yu
%A ZHANG Shu-Gang
%A DU Jin-Xin
%A LI Zheng-Feng
%A Wang Gang
%A <br>陈启伟
%A 王永录
%A 张永光
%A 潘丽
%A 方玉珍
%A 蒋守田
%A 吕建亮
%A 周鹏
%A 张中旺
%A 张昱
%A 张淑刚
%A 杜进鑫
%A 李正丰
%A 王刚
%J 微生物学通报
%D 2009
%I 
%X 以口蹄疫病毒株AF72 RNA为模板, 反转录并扩增目的基因, PCR纯化产物与pGEM T- Easy载体连接并转化JM109菌株, 用凝胶电泳、PCR和SpeⅠ/ SphⅠ双酶切法鉴定为阳性的重组质粒进行测序。比对测序结果确定AF72 VP3的核苷酸序列, 利用同源建模的方法建立AF72 VP3结构蛋白的3D结构, 在此基础上, 综合亲水性、可塑性、抗原指数以及表面可能性等参数预测AF72 VP3结构蛋白的B细胞抗原表位。分析表明, 口蹄疫病毒VP1、VP2、VP3和VP4在核苷酸水平上的变异率是无差异的(P > 0.05); 而它们在氨基酸水平上的变异率差异显著(P < 0.05)。该毒株与20株源于GenBank中的VP3氨基酸序列比对发现其保守区主要位于第1~24、24~35、36~42、45~56、65~122、124~172、177~210、211~219位。AF72 VP3结构蛋白三维空间结构可分为A、B和C 3个结构区域, 蛋白呈现较规则的空间构象, 其中18~23、30~44、60~75、113~124、130~142、193~220氨基酸区段是AF72 VP3结构蛋白可能的B细胞抗原表位区域, 该结果将为进一步的FMDV多表位疫苗研究提供更有价值的参考信息。
%K FMDV
%K VP3 structure protein
%K 3D model
%K B-cell epitope<br>口蹄疫病毒
%K VP3结构蛋白
%K 3D结构
%K B细胞表位
%U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=78024727B5F4EF6AA9CA8E605B5FC464&aid=B0D5A65BF6B73770435AC2A98989EDE0&yid=DE12191FBD62783C&vid=933658645952ED9F&iid=708DD6B15D2464E8&sid=ADAF655E679AEBA1&eid=72C9FC6259F90AE2&journal_id=0253-2654&journal_name=微生物学通报&referenced_num=0&reference_num=0