%0 Journal Article
%T Screening of SSR core primers with polymorphism on a cotton panel<br>基于棉花参比种质的SSR多态性核心引物筛选
%A Zhao-E Pan
%A Junling Sun
%A Xiwen Wang
%A Yinhua Jia
%A Zhongli Zhou
%A Baoyin Pang
%A Xiongming Du
%A <br>潘兆娥
%A 孙君灵
%A 王西文
%A 贾银华
%A 周忠丽
%A 庞保印
%A 杜雄明
%J 生物多样性
%D 2008
%I Science Press
%X 棉花品种间遗传多样性的评价和遗传图谱构建都需要大量多态性的SSR标记。本研究通过构建棉花参比种质(panel), 高效快速地筛选出棉花多态性核心引物。本实验选用12份表型性状和遗传差异较大的棉花种质作为参比种质, 对来自Cotton Microsatellite Database (CMD)网站上 (http://www.cottonssr.org) 的5,914对棉花SSR引物进行了PCR扩增。结果表明: 在不同棉种间多态性的引物有4,800对, 约占有效扩增引物(5,300对)的90.6%; 能区分不同品种间差异的引物大约有500对, 占有效扩增引物的9.4%。我们推荐其中319对扩增效果好、条带清晰的引物作为棉花种质资源鉴定和分子指纹分析的核心引物, 其中277对能把陆地棉品种间的差异鉴别出来。此外, 我们还找到了在陆地棉、海岛棉及亚洲棉三大栽培棉中都有差异的13对共同SSR引物, 建议作为分子指纹分析和种质鉴定的首选引物。本研究公开了319对核心SSR引物及其多态性信息, 有利于规范引物筛选程序、提高引物筛选效率, 对棉花种质资源的遗传多样性分析、指纹图谱构建, 以及种子真伪性和纯度的鉴定等都具有现实意义。
%K SSR<br>棉花
%K 引物
%K 多态性
%U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=284A3BE2D09272C2DA95716775015427&aid=5EE382CA5BEC47B5A208301DEA0E2F67&yid=67289AFF6305E306&vid=7801E6FC5AE9020C&iid=B31275AF3241DB2D&sid=AF4A4411BB448A36&eid=B4F9D541F855CF96&journal_id=1005-0094&journal_name=生物多样性&referenced_num=7&reference_num=25