%0 Journal Article
%T Bacteria diversity in paddy field soil by 16S rDNA-RFLP analysis in Ningxia<br>应用16SrDNA-RFLP方法分析宁夏地区稻田土壤细菌的多样性
%A Jianping Zhang
%A Naiyuan Dong
%A Haobin Yu
%A Yongjun Zhou
%A Yongliang Lu
%A Ruimei Geng
%A Liuqing Yu
%A <br>张建萍
%A 董乃源
%A 余浩滨
%A 周勇军
%A 陆永良
%A 耿锐梅
%A 余柳青
%J 生物多样性
%D 2008
%I Science Press
%X 水稻是宁夏地区主要粮食作物, 水稻种植也具有维持生态系统平衡, 防止土地荒漠化等重要的生态功能。而稻田土壤细菌是维持土壤生态功能的基础。但长期以来缺乏对干旱地区稻田土壤细菌多样性的认识。本研究采用非培养技术提取稻田土壤样品总DNA, 构建其16S rDNA克隆文库, 用PCR-RFLP分析进一步测序后聚类分析细菌群落的多样性。从稻田土样中分离获得了大于23 kb的DNA片段。PCR-RFLP共得到74种酶切带型, 序列分析发现77.3%的克隆序列与环境中未培养细菌的16S rDNA序列有较高的相似性, 仅有22.7%的克隆序列与数据库中可培养细菌有较高的相似性, 表明宁夏稻区土壤中的多数细菌尚未培养。系统发育研究发现74个序列分属于12个类群, 其中变形细菌所占比例最大(37.8%), 依次为酸杆菌(16.2%)、放线菌(12.2%)、拟杆菌(10.8%)、绿屈挠菌(10.8%)、浮游霉菌(8.1%), 另外有少量厚壁菌门、芽单胞菌门和疣微菌门细菌克隆。在变形细菌的序列中包括&#61537;、&#61538;、γ和δ 4个类型, 比例分别为13.5%、5.4%、12.2%和6.8%。表明宁夏稻区土壤中优势细菌类群为变形杆菌和酸杆菌, 且土壤细菌类群具有丰富的多样性。
%K 水稻田
%K 土壤细菌多样性
%K 16S
%K rDNA克隆文库
%K RFLP分析
%U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=284A3BE2D09272C2DA95716775015427&aid=3A29F92A0BAEF3B99C3BDCA25EFC385F&yid=67289AFF6305E306&vid=7801E6FC5AE9020C&iid=B31275AF3241DB2D&sid=CD26609C367AC9C8&eid=106103EB0EA31435&journal_id=1005-0094&journal_name=生物多样性&referenced_num=1&reference_num=27