%0 Journal Article %T Data analysis in population genetics.Ⅰ. Analysis of RAPD data with AMOVA
群体遗传学研究中的数据处理方法Ⅰ.RAPD数据的AMOVA分析 %A 张富民 %A 葛颂 %J 生物多样性 %D 2002 %I Science Press %X 近年来,RAPD数据和AMOVA分析广泛地应用于群体遗传学和保护遗传学研究。然而,由于RAPD标记具显性特点,加上目前进行AMOVA分析所依赖的RAPDistance软件不完善,使得对RAPD数据进行AMOVA分析时存在许多不足。本文介绍了AMOVA分析的基本过程,同时引入一个新的程序DCFA用以替代RAPDistance,并详述了将DCFA与WINAMOVA联用,对RAPD数据进行AMOVA分析的具体步骤与注意事项。最后,以产自中国和巴西8个普通野生稻(Oryza rufipogon)天然群体为例,演示了对RAPD表型数据进行AMOVA分析的过程,讨论了AMOVA分析结果在群体遗传结构上的意义。通过对AMOVA算法的分析,同时比较4种距离系数所得AMOVA结果,我们认为在进行AMOVA分析时选择NEILI距离和欧氏距离平方较为合适,而目前国内使用较多的JACCARD系数不适合AMOVA分析。 %K RAPDistance %K DCFA
群体遗传结构 %K RAPDistance %K DCFA %K 进化距离 %U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=284A3BE2D09272C2DA95716775015427&aid=CA04800E2C376A0A6594A791A2A2BE6C&yid=C3ACC247184A22C1&vid=F3090AE9B60B7ED1&iid=E158A972A605785F&sid=BEE722AB5028E81F&eid=68FDAD96FCC0AB1B&journal_id=1005-0094&journal_name=生物多样性&referenced_num=28&reference_num=0