%0 Journal Article %T Optimization of ISSR analysis and study on genetic diversity of two nature populations of Hemibarbus from Oujiang River
瓯江2种鱼骨 的ISSR分析优化和自然种群遗传多样性的研究 %A 吕耀平 %A 胡则辉 %A 叶丽平 %J 水生生物学报 %D 2008 %I %X 以唇鱼骨]和花鱼骨]为材料,对影响PCR反应的主要因子-模板DNA、引物、dNTPs、Mg2+、Taq酶浓度进行优化,建立了适合唇鱼骨]和花鱼骨]基因组DNA的ISSR—PCR反应体系。25灿L的PCR反应液含有的组分和终浓度分别为:约60ng模板DNA、1.2UTaq酶、0.4μmol/L引物、2.0mmol/LMgCl,、0.2mmol/LdNTPs、2%甲酰胺。利用优化反应体系从60个ISSR引物中,筛选出18个稳定性高、重复性好的引物,对25个唇鱼骨]个体和22个花鱼骨]个体的DNA进行正式扩增,分别从两个种群分别扩增到168和156条扩增谱带,扩增片段长度在200--1500bp之间。根据扩增结果计算出两个种群的多态位点比例分别为67.52%和53.21%,Shannon多样性指数分别为0.3450和0.2749,Nei’s指数分别为0.2292和0.1837,平均有效等位基因数分别为1.3875和1.3169。两个种群内样本间的平均遗传距离分别为0.2129和0.1529,结果表明两个种群的遗传多态性较高,其中唇鱼骨]的多样性明显高于花鱼骨]群体。引物UBC845扩增的610bp带和UBC854扩增的1240bp带为唇鱼骨]种的特异性谱带。鱼骨]属鱼类基因组中均含有微卫星DNA序列:(AG)8、(GA)8、(CT)8和(GAA)8。本研究为唇鱼骨]和花鱼骨]的种质保护、合理开发利用以及选择育种提供了一些基础数据。 %K 唇[鱼骨] %K 花[鱼骨] %K ISSR %K 优化 %K 遗传多样性 %K 分子标记 %U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=256651267D5D2E4520A7707D05E98747&aid=7F4B6356A8F09FDC2CA18E9931A8F29F&yid=67289AFF6305E306&vid=9971A5E270697F23&iid=E158A972A605785F&sid=CA4FD0336C81A37A&journal_id=1000-3207&journal_name=水生生物学报&referenced_num=1&reference_num=32