%0 Journal Article
%T D-loop sequence variation of mitochondrial DNA in Captive Brown-eared Pheasant (Crossoptilon mantchuricum)
褐马鸡圈养种群的mtDNA控制区多态性
%A wuyuzhen
%A
武玉珍
%A 王孟本
%A 张峰
%J 生态学报
%D 2010
%I
%X 褐马鸡(Crossoptilon mantchuricum)是我国特有的濒危鸟类,国家一级保护动物。为了保护褐马鸡的种质资源,从分子水平上评价褐马鸡的遗传多样性,对山西省庞泉沟自然保护区、太原市动物园的褐马鸡种群20个个体,线粒体DNA D-loop区全序列进行了克隆和测定,使用Clustal X、DnaSP4.0、Mega3.1等生物信息学软件,对全部20条序列开展了比对分析,确定了多态位点与单倍型数目,计算了核苷酸多样性和单倍型多样性;比较了两个种群的遗传变异,初步探讨了褐马鸡种群的遗传多样性和遗传结构。结果表明:20条褐马鸡线粒体DNA D-loop区全序列长度在1236-1237bp之间, 其中A、T、G和C 4种核苷酸的平均含量分别为 31.0%、 26.8%、27.5%和 14.8%,A+T含量(57.8%)高于G+C含量(42.3%)。排除1处核苷酸的插入或缺失后,共检测出26个突变位点,占分析序列总长度的2.1%,其中包括25处单一多态位点和1处简约信息位点。20个个体检测出13个单倍型,其中11个个体具有独特的单倍型,2个共享单倍型。褐马鸡两个种群的单倍型多样性(h)为0.911-0933,核苷酸多样性(π)为0.002-0.003,单倍型间的遗传距离为0.003-0.002。根据单倍型构建了褐马鸡两个种群的NJ分子系统树。聚类表明,2个种群的个体并没有按相应的地理位置进行聚类。揭示褐马鸡具有较高的单倍型多样性和较低的核苷酸多样性,种群的遗传变异较低;两个种群单倍型间的遗传距离较近,遗传多样性参数接近,统计分析无显著差异,两个种群尚未表现出明显的遗传分化,且两个种群间有基因流存在。
%K Crossoptilon mantchuricum
%K mitochondrial DNA D-loop
%K genetic diversity: conservation
褐马鸡
%K mtDNA控制区
%K 遗传多样性
%K 保护
%U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=FE163E5DB2274E5937319DE98913EC37&aid=1EE37AB0A05AB0455F60F3FEE98EDC7C&yid=140ECF96957D60B2&vid=340AC2BF8E7AB4FD&iid=708DD6B15D2464E8&sid=D58B400F0C66CC96&eid=438B6D498F05EE69&journal_id=1000-0933&journal_name=生态学报&referenced_num=0&reference_num=0