%0 Journal Article
%T Screening of microsatellite markers in Alexandrium spp.<br>亚历山大藻属微卫星标记的筛选
%A WANG Dong-Dong
%A YANG Wei-Dong
%A LIU Jie-Sheng
%A <br>王东东
%A 杨维东
%A 刘洁生
%J 生态学报
%D 2009
%I 
%X 采用生物信息学方法,从塔玛亚历山大藻的ESTs数据库中筛选微卫星(Simple Sequence Repeat, SSR)位点,设计SSR引物,利用毛细管电泳对4株塔玛亚历山大藻(Alexandrium tamarense)、2株相关亚历山大藻(Alexandrium affine)和1株链状亚历山大藻(Alexandrium catenella)进行种内、种间遗传多样性分析,获得以下主要结果:(1)从6830条非冗余的ESTs中共查找到222个SSR,平均每18.5kb就有一个SSR,三核苷酸重复在所有的重复类型中所占比例最大,达到48.2%,重复单元CTG/CAG出现频率最高.进一步筛选出12条SSR引物,用于遗传多样性分析.(2)种内遗传多样性水平整体偏低,多态性引物比率仅为41 67%,Nei's基因多样性平均为0.2130.种间遗传多样性水平较高,多态性引物比率为75%,Nei's基因多样性平均水平为0 4643;另外,种间遗传分化系数较高,平均水平为0.7051.(3)对7个样品的聚类图分析发现,A. tamarense CCMP116 与A. affine CCMP112遗传距离极为接近;A. tamarense ATHK9301、CCMP1598和ATDH01相互聚在一起;A. catenella ACDH01与A. tamarense分属两枝.以上结果表明,SSR标记在亚历山大藻种内遗传多样性分析方面是一种非常有用的工具.
%K Alexanderium spp
%K EST
%K SSR
%K Genetic diversity<br>亚历山大藻
%K 表达序列标签
%K 微卫星标记
%K 遗传多样性
%U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=FE163E5DB2274E5937319DE98913EC37&aid=C661C2232505E2F0B63565B054E10478&yid=DE12191FBD62783C&vid=771469D9D58C34FF&iid=E158A972A605785F&sid=C83A8C68D6FA0736&eid=72AC0867AA69EEA5&journal_id=1000-0933&journal_name=生态学报&referenced_num=2&reference_num=28