%0 Journal Article %T Diversity and phylogeny of rhizobial strains isolated from root nodules of Lespedeza Michx in arid-hot valley of Jinsha River
金沙江干热河谷区胡枝子(Lespedeza Michx)根瘤菌多样性及其系统发育 %A PENG Xian-Chao %A ZHANG Xiao-Ping %A XU Kai-Wei %A HUANG Chang-Xue %A KLindstrom %A
彭贤超 %A 张小平 %A 徐开未 %A 黄昌学 %A K.Lindstrom %J 生态学报 %D 2008 %I %X 研究利用数值分类、BOXAIR-PCR指纹图谱、16SrDNA PCR-RFLP、16S rDNA和GSⅡ序列分析等方法,研究了分离自金沙江干热河谷区的86株胡枝子根瘤菌的多样性和系统发育,结果表明金沙江干热河谷区胡枝子根瘤菌蕴涵丰富的生物多样性。通过数值分类,供试未知菌株表现出极大的表型性状多样性,能耐高温(60℃)和低pH(4.0),在低温(10℃)或者高pH(9.0)条件下生长很差,耐盐性也很差。供试未知菌株的16S rDNA用HaeⅢ、MspⅠ、HinfⅠ和TaqⅠ酶切后具有16种遗传图谱类型,其中10株供试未知菌的16S rDNA遗传图谱类型不同于所选用的已知参比菌株。BOXAIR-PCR的分群结果分散,很多在16S rDNA PCR-RFLP中具有相同遗传类型的菌株也表现较大差异,表明了供试菌株在基因组水平上差异很大。序列分析结果表明,6株代表菌株分布于Rhizobium、Sinorhizobium、Mesorhizobium、Bradyrhizobium4个属,16S rDNA序列与GSⅡ序列分别构建的系统发育树在属水平上基本一致,但16S rDNA序列的同源性比GSⅡ高,6株代表菌株间16S rDNA序列的同源性在87.5%~99.5%之间,GSⅡ序列的同源性在79.4%~89.8%之间;而代表菌株与亲缘关系最近的参比菌株间的16S rDNA序列的同源性为99.9%~100%,GSⅡ的同源性为88.9%~99.6%。 %K BOXAIR-PCR %K 16S rDNA %K PCR-RFLP
数值分类 %K BOXAIR-PCR %K 16S %K rDNA %K PCR-RFLP %K GSⅡ基因 %K 序列分析 %U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=FE163E5DB2274E5937319DE98913EC37&aid=7C0F85FCCB802E20F3FF393B07E9F784&yid=67289AFF6305E306&vid=D3E34374A0D77D7F&iid=708DD6B15D2464E8&sid=37833B6C6C49FBD0&eid=C786AD36162BD39A&journal_id=1000-0933&journal_name=生态学报&referenced_num=1&reference_num=20