%0 Journal Article %T Phylogenetic diversity of bacteria associated with dinoflagellate Alexandrium catenella
链状亚历山大藻共附生细菌多样性 %A LIU Bing %A LI Yu %A YE Qian %A LI Tai-wu %A SU Xiu-rong %A LI Deng-feng %A CHEN Yan %A SHI Xi-zhi %A
刘兵 %A 李宇 %A 叶倩 %A 李太武 %A 苏秀榕 %A 李登峰 %A 陈燕 %A 史西志 %J 生态学杂志 %D 2009 %I %X 采用非分离培养分析方法,直接提取链状亚历山大藻(Alexandrium catenella)共附生细菌总DNA,以之为模板进行PCR扩增获得细菌16S rDNA基因片段,并构建16S rDNA克隆文库。通过16S rDNA限制性酶切片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)和测序方法对链状亚历山大藻共附生细菌的多样性进行了研究。84个16S rDNA克隆片段经限制性内切酶HaeⅢ酶切分析,得到30种不同的酶切指纹类型。挑选50个克隆子进行测序获得其16S rDNA部分序列,并对16S rDNA序列进行聚类分析构建了系统进化树。结果表明,链状亚历山大藻共附生的细菌多样性较强,优势细菌类群为变形菌α亚群(α-Proteobacteria)和拟杆菌(Bacteroidetes),其中玫瑰杆菌(Roseobacter sp.)在α-Proteobacteria中占绝对优势。 %K 16S rDNA %K RFLP
链状亚历山大藻 %K 细菌多样性 %U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=B04840A985D251F36078BD07A90EF003&aid=0F4DD55EAF226B33CAD8D9D2C12EFD52&yid=DE12191FBD62783C&vid=D3E34374A0D77D7F&iid=94C357A881DFC066&sid=BF6EDE6C10074464&eid=117143DBED3B4430&journal_id=1000-4890&journal_name=生态学杂志&referenced_num=0&reference_num=0