%0 Journal Article
%T Phylogenetic diversity of bacteria associated with dinoflagellate Alexandrium catenella
链状亚历山大藻共附生细菌多样性
%A LIU Bing
%A LI Yu
%A YE Qian
%A LI Tai-wu
%A SU Xiu-rong
%A LI Deng-feng
%A CHEN Yan
%A SHI Xi-zhi
%A
刘兵
%A 李宇
%A 叶倩
%A 李太武
%A 苏秀榕
%A 李登峰
%A 陈燕
%A 史西志
%J 生态学杂志
%D 2009
%I
%X 采用非分离培养分析方法,直接提取链状亚历山大藻(Alexandrium catenella)共附生细菌总DNA,以之为模板进行PCR扩增获得细菌16S rDNA基因片段,并构建16S rDNA克隆文库。通过16S rDNA限制性酶切片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)和测序方法对链状亚历山大藻共附生细菌的多样性进行了研究。84个16S rDNA克隆片段经限制性内切酶HaeⅢ酶切分析,得到30种不同的酶切指纹类型。挑选50个克隆子进行测序获得其16S rDNA部分序列,并对16S rDNA序列进行聚类分析构建了系统进化树。结果表明,链状亚历山大藻共附生的细菌多样性较强,优势细菌类群为变形菌α亚群(α-Proteobacteria)和拟杆菌(Bacteroidetes),其中玫瑰杆菌(Roseobacter sp.)在α-Proteobacteria中占绝对优势。
%K 16S rDNA
%K RFLP
链状亚历山大藻
%K 细菌多样性
%U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=B04840A985D251F36078BD07A90EF003&aid=0F4DD55EAF226B33CAD8D9D2C12EFD52&yid=DE12191FBD62783C&vid=D3E34374A0D77D7F&iid=94C357A881DFC066&sid=BF6EDE6C10074464&eid=117143DBED3B4430&journal_id=1000-4890&journal_name=生态学杂志&referenced_num=0&reference_num=0