%0 Journal Article
%T An extraction method of fungal DNA from soils in North China<br>提取北方土壤真菌DNA的一种方法
%A WU Min-na
%A ZHANG Hui-wen
%A LI Xin-yu
%A SU Zhen-cheng
%A ZHANG Cheng-gang
%A <br>吴敏娜
%A 张惠文
%A 李新宇
%A 苏振成
%A 张成刚
%J 生态学杂志
%D 2007
%I 
%X 由于土壤理化性质的复杂性和真菌细胞壁结构的特殊性,从土壤样品中提取真菌基因组DNA比较困难.中国北方土壤与其它地区土壤相比有其自身的特点,因此,有必要优化一种适合于北方土壤真菌DNA提取的方法.本实验向灭菌黑土中分别投加12种在系统分类上差别较大的真菌,以传统土壤总DNA提取方法及纯菌DNA提取方法为基础,分别与蜗牛酶,纤维素酶进行组合、优化,得到7种不同的土壤真菌基因组DNA提取方法.利用真菌28S rDNA通用引物U1/U2-GC PCR-DGGE分析方法分别考察了7种不同方法所提取土壤真菌基因组DNA的多样性和代表性.结果表明:1)液氮研磨,纤维素酶、蜗牛酶和溶菌酶(浓度分别为6 、3和1 mg·ml-1)37 ℃作用60 min,2% SDS于65 ℃裂解30 min;2)-65 ℃～65 ℃冻融3次,纤维素酶、蜗牛酶和溶菌酶(浓度分别为6、3和1 mg·ml-1)37 ℃作用180 min,2%SDS于65 ℃裂解30 min的组合具有较好的提取效果.利用后一种方法分别对3种理化性质差异较大的中国北方自然土壤样品真菌DNA进行提取并分析,表明所提取土壤基因组DNA真菌特异性PCR-DGGE图谱条带丰富,该方法可用于多种北方土壤真菌多样性研究.
%K 28SrDNA
%K PCR-DGGE<br>真菌
%K 中国北方
%K DNA提取
%K 多样性
%U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=B04840A985D251F36078BD07A90EF003&aid=C4EEEF6B0A18C909&yid=A732AF04DDA03BB3&vid=96C778EE049EE47D&iid=E158A972A605785F&sid=FED67FBA0A707330&eid=984BD2F4D19B9D1C&journal_id=1000-4890&journal_name=生态学杂志&referenced_num=4&reference_num=30