%0 Journal Article %T Comparative analysis of mitochondrial DNA Cytb gene and their molecular identification markers in three species of soft-turtles
三种鳖线粒体DNA细胞色素b基因序列的比较分析 %A CHEN He-Ge %A LIU Wen-Bin %A LI Jian-Zhong %A ZHANG Xuan-Jie %A
陈合格 %A 刘文彬 %A 李建中 %A 张轩杰 %J 水生生物学报 %D 2006 %I %X 对中华鳖、砂鳖和山瑞鳖线粒体DNA细胞色素b基因进行了引物设计、PCR扩增、序列测定和PCR-PFLP(Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism)分析。研究结果表明中华鳖、砂鳖与山瑞鳖线粒体DNACytb基因的序列全长相同,均为1140bp,其A、C、G、T含量相似,分别为378个(33.2%)、322个(28.2%)1、22个(10.7%)、318个(27.9%)、373个(32.7%)、324个(28.4%)、124个(10.9%)、319个(28.0%)、380个(33.3%)3、30个(28.9%)、127个(11.1%)、303个(26.7%)。同源性及序列差异率分析表明:中华鳖与砂鳖b基因序列的同源性为92.3%,中华鳖、山瑞鳖的为85.0%,砂鳖、山瑞鳖的为84.1%;中华鳖与砂鳖b基因核苷酸序列间的差异率为7.7%,中华鳖、山瑞鳖间的序列差异率为15.0%,砂鳖、山瑞鳖间的序列差异率为15.9%,而中华鳖、砂鳖、山瑞鳖各自个体间的序列差异率分别为2.37%、0.88%和0.18%,种间差异显著。用内切酶酶切分析其扩增产物,结果表明:用内切酶NdeⅠ可准确鉴别砂鳖,而用内切酶BamHⅠ则可准确鉴别山瑞鳖。内切酶NdeⅠ和BamHⅠ的联用分析,可使这三种鳖在分子水平都得到明确的鉴定。从三种鳖线粒体DNACytb基因核苷酸序列的显著差异和酶切位点的变化,可以进一步证明砂鳖是不同于中华鳖的鳖属一新种。 %K Pelodiscus sinensis %K Pelodiscus axenaria %K Palea steindachneri %K Cytb gene %K PCR-RFLP assay %K Molecular identification marker
中华鳖 %K 砂鳖 %K 山瑞鳖 %K 细胞色素b %K PCR-RFLP分析 %K 分子鉴定标记 %U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=256651267D5D2E4520A7707D05E98747&aid=16BC4A76F28EE4C4&yid=37904DC365DD7266&vid=340AC2BF8E7AB4FD&iid=E158A972A605785F&sid=A7AE820C12CC9AD3&eid=44FDB9366EDDFA2B&journal_id=1000-3207&journal_name=水生生物学报&referenced_num=1&reference_num=20