%0 Journal Article
%T Aplicaci車n del an芍lisis de rango reescalado R/S para la predicci車n de genes en el genoma vegetal
%A Almanza Pinz車n Martha Isabel
%A L車pez L車pez Karina
%A T谷llez Villa Carlos Eduardo
%J Acta Agron車mica
%D 2010
%I Universidad Nacional de Colombia Sede Palmira
%X La predicci車n de genes es en la actualidad uno de los principales desaf赤os de la gen車mica. La predicci車n permite realizar experimentos con alta probabilidad de encontrar genes de inter谷s y comparar regiones de ADN de importancia agron車mica entre genomas; adem芍s, ayuda a restringir los espacios de b迆squeda en las bases de datos. Un procedimiento estad赤stico con base en el an芍lisis R/S y el coeficiente de Hurst fue desarrollado para caracterizar y predecir genes y los componentes estructurales de estos (exones e intrones) en los genomas eucariotas completos de Arabidopsis thaliana, Oriza sativa y Mus musculus. Algoritmos en lenguaje de programaci車n Python fueron desarrollados para extraer, filtrar y modelar m芍s del 80% de las secuencias de genes registradas para estos genomas en la base de datos del GeneBank del NCBI.  El an芍lisis R/S permiti車 demostrar que existe un orden estructural en la distribuci車n de los nucle車tidos que constituyen las secuencias en las que predominan los fen車menos de memoria o dependencia de largo alcance. La estructura de memoria var赤a seg迆n el tipo de secuencias y el genoma de la especie. Las secuencias de los genes y exones de los genomas vegetales analizados presentaron comportamiento persistente mientras que las de los intrones tuvieron un comportamiento antipersistente, en comparaci車n, al genoma animal en el cual los tres tipos de secuencias presentaron comportamiento persistente. De acuerdo con los par芍metros provenientes del an芍lisis R/S, el patr車n de distribuci車n de las secuencias del genoma se repiti車 de manera estad赤sticamente similar en cada uno de los cromosomas que pertenecen a una especie, constituy谷ndose en evidencias fundamentales de invarianza por cambio de escala; es decir, cada cromosoma por s赤 solo es una r谷plica estad赤stica a menor escala del genoma completo. Los par芍metros constituyeron criterios compactos para derivar predictores (clasificadores) de secuencias que alcanzaron promedios de sensibilidad y especificidad mayor del 81% y 70%, respectivamente. Este procedimiento podr赤a ser probado en otros genomas y utilizado como criterio para incrementar la eficiencia de la selecci車n en los programas de mejoramiento gen谷tico vegetal.
%K Gen車mica comparativa
%K predicci車n de genes
%K an芍lisis R/S
%K coeficiente de Hurst
%K Arabidopsis thaliana
%K Oryza sativa
%K Mus musculus
%U http://revistas.unal.edu.co/index.php/acta_agronomica/article/view/20132