%0 Journal Article
%T SNP analysis of the fragments of three functional genes of the mushroom Lentinula edodes<br>香菇三个功能基因部分序列的单核苷酸多态性分析
%A WANG Da-Li
%A ZHANG Jin-Xi
%A BIAN Yin-Bing
%A CHEN Qiang
%A HUANG Chen-Yang
%A <br>王大莉
%A 张金霞
%A 边银丙
%A 陈强
%A 黄晨阳
%J 菌物学报
%D 2013
%I 
%X 以15个香菇栽培品种为材料，对尿嘧啶核苷酸-胞嘧啶核苷酸激酶基因（UMP-CMP kinase gene，uck1）、分裂原活化蛋白激酶基因（mitogen-activated protein kinase gene，mapk）和外切β-1,3葡聚糖酶基因（exo-β-1,3-glucanase-encoding gene，exg1）进行了部分序列的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）分析。结果表明，测序中出现的双峰，是菌丝双核体细胞中两细胞核之间的差异造成的。在采用uck1、mapk和exg1的3,126bp中，共发现48处多态性位点，发生频率为1/65bp，其中36个属于转换、12个为颠换。从群体发生频率上，38个属于超过10%的常见SNP，10个属于罕见SNP。不同基因的SNP发生频率不同，uck1、mapk和exg1的SNP发生频率分别为1.40%、0.82%和2.41%。外显子区SNP数量高于内含子，3个基因在外显子区域分布28个，内含子分布20个。外显子的28个SNP位点中，11个为错义突变，17个为同义突变。错义突变引起了编码氨基酸的改变。对SNP位点的聚类分析表明，15个栽培品种间存在的多态性位点在1–36之间，15个品种的SNP类型不同。uck1，mapk，exg1的SNP可用于香菇栽培品种的鉴别。
%K single nucleotide polymorphisms
%K exon
%K missense mutation
%K cultivar discrimination<br>单核苷酸多态性，外显子，错义突变，品种鉴别
%U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=CA9F815FCB0F62294C4266BB6F902ACB&aid=E036B4DC96F1D7EDC53277897CA2C667&yid=FF7AA908D58E97FA&vid=9971A5E270697F23&iid=CA4FD0336C81A37A&sid=35FC3610259C2B32&eid=7E8E8B150580E4AB&journal_id=1672-6472&journal_name=菌物学报&referenced_num=0&reference_num=0