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Detección, identificación y localización geográfica de Begomovirus que afectan al tomate en Colombia
Vaca-Vaca,Juan Carlos; Betancurt-Pérez,Jhon Fredy; López-López,Karina;
Revista Colombiana de Biotecnología , 2011,
Abstract: the begomoviruses (family geminiviridae) have recently emerged as a serious pathogens of agronomic and horticultural crops in subtropical and tropical regions of world. these viruses are transmitted by the whitefly (bemisia tabaci) that recently has got a significant increase in its populations and also has been associated with the appearance of geminivirus typical symptoms in tomato crops around colombia. tomato samples with typical begomovirus symptoms were collected in five different departments, comprising the mayor tomato growing areas of the country. begomovirus were detected by polymerase chain reaction (pcr) or dot blot hybridization in all tomato samples collected in whole tomato growing areas of the country. with exception for valle del cauca, this is the first report of tomato-infecting begomovirus in antioquia, santander, boyacá and cundinamarca departments. also this is the first report of tomato-infecting begomovirus crops located above 1500 masl in colombia.
Distribución y diversidad genética de Begomovirus que infectan tomate (Solanum lycopersicum L) en Colombia
Vaca-Vaca,Juan Carlos; Betancur-Pérez,Jhon Fredy; López-López,Karina;
Revista Colombiana de Biotecnología , 2012,
Abstract: diseased caused by begomoviruses (family geminiviridae) constitute a serious constraint to tomato production in colombia. however characterization of these new viruses had not been carried out so far. here we report a large scale survey on the distribution and genetic diversity of tomato infecting geminiviruses which are affecting mayor growing area of this crop in the country. viruses were detected by pcr using universal primers for members of genus begomovirus. the rflp analysis of pcr-amplified fragments showed individual and mixed infections of several geminiviruses in many of the samples. pcr-amplified fragments were cloned and sequenced. based on sequence comparations and phylogenetic analysis, the colombian geminivirus isolates were new world bipartite geminiviruses showing close relationship with pymv and tovev. by means of bioinformatic analysis of cis-acting elements (iterons) involved in dna replication of rep gene of colombian geminivirus isolates was possible to postulate possible pseudorecombinación events that could occur between them but also confirm the occurrence of mixed infections.
Detección, identificación y localización geográfica de Begomovirus que afectan al tomate en Colombia
Vaca-Vaca Juan Carlos,Betancurt-Pérez Jhon Fredy,López-López Karina
Revista Colombiana de Biotecnología , 2011,
Abstract: Detection, identification and geographical localization of tomato-infecting Begomovirus in Colombia Título corto: Begomovirus que afectan tomate en Colombia Resumen En la actualidad, los Begomovirus (Familia Geminiviridae) se han convertido en la mayor amenaza para los cultivos de interés agrícola ubicados en las zonas tropicales y templadas del planeta. Estos virus son transmitidos por la mosca blanca Bemisia tabaci, la cual en los últimos a os en Colombia ha tenido un aumento significativo en sus poblaciones y se ha asociado con la aparición de síntomas virales en cultivos de tomate. Muestras de tomate con síntomas virales típicos fueron recolectadas en las cinco principales zonas productoras de esta solanácea en el país. Los Begomovirus fueron detectados por medio de la técnica de hibridación de ácidos nucleicos tipo Dot blot así como por medio de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) en todas las muestras colectadas. Con la excepción de un reporte previo en el Valle del Cauca, este es el primer reporte de Begomovirus afectando cultivos de tomate en los departamentos de Antioquia, Santander, Boyacá y Cundinamarca. Asimismo, es la primera vez que se informa sobre Begomovirus que afectan cultivos de tomate localizados por encima de 1500 msnm en Colombia. Palabras clave: Begomovirus, Bemisia tabaci, tomate, Dot blot, PCR. Abstract The begomoviruses (Family Geminiviridae) have recently emerged as Key words: Begomovirus, Bemisia tabaci, tomato, Dot blot, PCR. samples with typical Begomovirus symptoms were collected in five different departments, comprising the mayor tomato growing areas of the country. Begomovirus were detected by Polymerase Chain Reaction (PCR) or Dot Blot Hybridization in all tomato samples collected in whole tomato growing areas of the country. With exception for Valle del Cauca, this is the first report of tomato-infecting Begomovirus in Antioquia, Santander, Boyacá and Cundinamarca departments. Also this is the first report of tomato-infecting Begomovirus crops located above 1500 masl in Colombia.
Distribución y diversidad genética de Begomovirus que infectan tomate (Solanum lycopersicum L) en Colombia
Vaca-Vaca Juan Carlos,Betancur-Pérez Jhon Fredy,López-López Karina
Revista Colombiana de Biotecnología , 2012,
Abstract: Título en ingles: Distribution and genetic diversity of tomato –infecting Begomovirus in Colombia Resumen: Las enfermedades causadas por los begomovirus, (Familia Geminiviridae) constituyen una serie limitante para la producción del tomate en Colombia. Sin embargo, la caracterización de estos virus no ha sido realizada al momento. Aquí presentamos los resultados de un muestreo a nivel nacional que buscaba conocer la distribución y diversidad genética de los geminivirus que están afectando el cultivo de tomate en Colombia. Los virus fueron detectados mediante PCR, empleando primer universales específicos para el género Begomovirus. Los fragmentos amplificados por PCR fueron sometidos a un análisis tipo RFLP cuyos resultados evidenciaron presencia de infecciones mixtas e individuales de geminivirus en la mayoría de las muestras recolectadas en campo. Los fragmentos amplificados por PCR fueron clonados y secuenciados. El análisis de secuencia y filogenético mostró que los aislados begomovirales colombianos eran gemininivirus bipartitas típicos del Hemisferio Occidental y que algunos eran variantes de PYMV y otros de ToTEV. Mediante el análisis de los elementos cis-regulatorios (iterones) presentes en el promotor del gen de la proteína asociada a replicación (Rep) de los begomovirus aislados es posible postular eventos de pseudorecombinación que podrían suceder entre ellos durante la ocurrencia de infecciones mixtas en tomate. Palabras claves: Geminivirus; Solanum licopersicum; PCR-RFLP; infecciones mixtas. Abstract: Diseased caused by begomoviruses (Family Geminiviridae) constitute a serious constraint to tomato production in Colombia. However characterization of these new viruses had not been carried out so far. Here we report a large scale survey on the distribution and genetic diversity of tomato infecting geminiviruses which are affecting mayor growing area of this crop in the country. Viruses were detected by PCR using universal primers for members of genus Begomovirus. The RFLP analysis of PCR-amplified fragments showed individual and mixed infections of several geminiviruses in many of the samples. PCR-amplified fragments were cloned and sequenced. Based on sequence comparations and phylogenetic analysis, the Colombian geminivirus isolates were new world bipartite geminiviruses showing close relationship with PYMV and ToVEV. By means of bioinformatic analysis of cis-acting elements (iterons) involved in DNA replication of rep gene of Colombian geminivirus isolates was possible to postulate possible pseudorecombinación events that could occur betwee
Búsqueda de genes de resistencia al pasador del fruto en poblaciones segregantes de tomate
Rodríguez Mora Diana Milena,Betancur-Pérez Jhon Fredy,Vallejo Cabrera Franco Alirio,Vaca-Vaca Juan Carlos
Acta Agronómica , 2010,
Abstract: Las estrategias de mejoramiento genético para encontrar resistencia al pasador del fruto, Neoleucinodes elegantalis, en tomate, Solanum lycopersicum L. se han basado en métodos tradicionales de introgresión genética por medio de retrocruzamiento. Sin embargo este proceso es largo y dispendioso. Debido a esta problemática, se utilizó la técnica molecular cDNA-AFLP para identificar genes involucrados en la resistencia a esta plaga en poblaciones segregantes de tomate, con el fin de identificar marcadores moleculares que puedan ser utilizados en futuros programas de fitomejoramiento. Los materiales de tomate evaluados fueron Unapal-Maravilla (susceptible), S. habrochaites var. glabratum, accesión PI 134418 (resistente) y tres retrocruzamientos obtenidos del cruzamiento interespecífico entre ambas especies. De estos materiales vegetales se extrajo el RNA total y se sintetizó el cDNA, el cual se utilizó como material de inicio de la técnica cDNA-AFLP. A partir del preamplificado de cDNA se evaluaron diferentes combinaciones de primers: +1+1, +3+3 y sus derivados. La combinación que presentó mejores amplificados fue la +1+1, para un total de 37 bandas polimórficas. De estas bandas, 9 fragmentos tipo EST (Expressed Sequence Target) fueron recuperados, siendo candidatos a explicar la resistencia al pasador del fruto en tomate.
Búsqueda de genes de resistencia al pasador del fruto en poblaciones segregantes de tomate
Rodríguez Mora,Diana Milena; Betancur-Pérez,Jhon Fredy; Vallejo Cabrera,Franco Alirio; Vaca-Vaca,Juan Carlos; López-López,Karina;
Acta Agronómica , 2010,
Abstract: breeding strategies for resistance to fruit borer neoleucinodes elegantalis in tomato solanum lycopersicum k l. have relied on traditional methods through genetic introgression by backcrossing. however, this process is slow and expensive. the cdna-aflp molecular technique was used to identify genes involved on fruit borer resistance in tomato segregating populations, the evaluated materials of tomato were: unapal maravilla (susceptible to fruit borer) , s. habrochaites var. glabratum, acc. pi 134418 (resistant to fruit borer), and three interspecific backcross produced by crossbreeding between those two species. from these plant materials, total rna was extracted and cdna-aflp technique was implemented. from the preamplified cdna, different combinations of primers: +1+1, +3+3 and their derivates were evaluated. the combination that showed better amplified was +1+1 for a total of 37 polymorphic bands and 9 fragments type expressed sequence target was isolated, which could explain the resistance of tomato to fruit borer.
EL áMBITO CORPORAL EN LA EDUCACIóN PRIMARIA UNA PROPUESTA CURRICULAR EL CURSO 2001-2002
Marcelino Juan Vaca Escribano
ágora para la Educación Física y el Deporte , 2001,
Abstract: : This paper describes the Curricular Proposal designed by a work group composed by Primary School teachers and teacher educators to tackle the new school year. This proposal focus upon the body and movement (PE) in Primary Education. We understand the Curricular Proposal as a complex mixture between the official guidance and the experience and knowledge of the group after ten years working together. We have identified four fields, each one having a number of basic lines in which the teaching and learning processes are developed. These processes are planned and evaluated together within the weekly meetings of the work group.Resumen: Este artículo describe la propuesta curricular con la que el grupo de trabajo, formado por maestros y profesores de la E.U.E. de Palencia, abordan el nuevo curso escolar en los temas relativos al cuerpo y la motricidad en la educación primaria. Entienden dicha propuesta como una compleja mezcla que surge de coordinar las orientaciones oficiales con la experiencia profesional. Después de diez a os de trabajo, han identificado cuatro grandes ámbitos en los que se dan cita un conjunto de líneas básicas en las que se agrupan los procesos de ense anza aprendizaje que los miembros del grupo planifican y evalúan conjuntamente en sus reuniones semanales.
Un proyecto para una escuela con cuerpo y en movimiento
Marcelino Juan Vaca Escribano
ágora para la Educación Física y el Deporte , 2007,
Abstract: Resumen: Estudiar y desarrollar el potencial educativo del ámbito corporal en la escuela nos ha llevado a construir un modelo, el Tratamiento Pedagógico del ámbito corporal. Este artículo trata de explicar su oportunidad en los planteamientos educativos generales, identifica lo que se ense a en educación física escolar y cómo se procura que repercuta en el desarrollo y aprendizaje del alumnado, y muestra el análisis de la práctica como la principal fuente de innovación educativa, desarrollo profesional y reflexión curricular. Abstract: Our studies on the educative potential of the body sphere within the school context and formal education have brought about the model 'Pedagogical Treatment of the Body sphere' (TPC: Tratamiento Pedagógico del ámbito Corporal). In this framework, we reflect about what is taught within PE and how we direct our attention to pupils' learning and development. Furthermore, we emphasize the role of the analysis of our practices as the main resource for innovation (i.e., PE aims, curricula, etc.) and professional development.
Molecular characterization of a fungal gene paralogue of the penicillin penDE gene of Penicillium chrysogenum
Carlos García-Estrada, Inmaculada Vaca, Ricardo V Ullán, Marco A van den Berg, Roel AL Bovenberg, Juan Martín
BMC Microbiology , 2009, DOI: 10.1186/1471-2180-9-104
Abstract: The IAL contains motifs characteristic of the IAT such as the processing site, but lacks the peroxisomal targeting sequence ARL. Null ial mutants and overexpressing strains indicated that IAL lacks acyltransferase (penicillin biosynthetic) and amidohydrolase (6-APA forming) activities in vivo. When the canonical ARL motif (leading to peroxisomal targeting) was added to the C-terminus of the IAL protein (IALARL) by site-directed mutagenesis, no penicillin biosynthetic activity was detected. Since the IAT is only active after an accurate self-processing of the preprotein into α and β subunits, self-processing of the IAL was tested in Escherichia coli. Overexpression experiments and SDS-PAGE analysis revealed that IAL is also self-processed in two subunits, but despite the correct processing, the enzyme remained inactive in vitro.No activity related to the penicillin biosynthesis was detected for the IAL. Sequence comparison among the P. chrysogenum IAL, the A. nidulans IAL homologue and the IAT, revealed that the lack of enzyme activity seems to be due to an alteration of the essential Ser309 in the thioesterase active site. Homologues of the ial gene have been found in many other ascomycetes, including non-penicillin producers. Our data suggest that like in A. nidulans, the ial and penDE genes might have been formed from a single ancestral gene that became duplicated during evolution, although a separate evolutive origin for the ial and penDE genes, is also discussed.The β-lactams are one of the most important classes of antibiotics. They are produced by different microorganisms, including filamentous fungi such as Penicillium chrysogenum and Aspergillus nidulans. These ascomycetes synthesize hydrophobic penicillins using three amino acids as precursors; L-α-aminoadipic acid, L-cysteine and L-valine to form the tripeptide δ (L-α-aminoadipyl)-L-cysteinyl-D-valine (ACV) by the multienzyme ACV synthetase (ACVS), which is encoded by the pcbAB gene. This tripeptide is con
TEORíAS Y PRáCTICAS DE CALIDAD EN EDUCACIóN FíSICA: UNA UNIDAD (DIDáCTICA) DE INVESTIGACIóN-ACCIóN | THEORY AND PRACTICES OF QUALITY IN PHYSICAL EDUCATION: A (DIDACTIC) UNIT OF ACTION-RESEACH
Marcelino-Juan Vaca-Escribano
ágora para la Educación Física y el Deporte , 2010,
Abstract: RESUMEN.- En el marco del Seminario sobre el Tratamiento Pedagógico de lo Corporal (Seminario TPC), se reúnen desde hace dos décadas docentes de Educación Física (EF) de distintos niveles educativos. Partiendo del análisis y condiciones reales de cada uno de sus miembros, uno de los objetivos de su trabajo es llevar a cabo unas prácticas educativas de calidad que, a su vez, se sustenten en teorías que, día a día, vayan siendo más coherentes y explícitas. La dinámica de trabajo que predomina en el Seminario responde, grosso modo, a la lógica de la investigación-acción. En este contexto, este artículo muestra el proceso seguido en torno a una 'unidad de investigación-acción', esto es, la planificación, desarrollo y evaluación de una unidad didáctica (UD) elegida al azar dentro de la Programación general anual de EF dise ada para un grupo de escolares de primer curso de Educación Primaria. En el texto se intenta poner de manifiesto la praxis completa de dicho mini-proceso; el trabajo colaborativo y las interdependencias entre los dos docentes implicados, el investigador y la maestra de EF escolar; el enriquecimiento del bagaje cultural y profesional de sus protagonistas; y, en fin, algunos de los indicadores del progreso de los ni os y ni as que asisten a las lecciones de EF. ABSTRACT.- During the last two decades, a group of PE teachers of different educational levels have met regularly within a seminar called 'Tratamiento Pedagógico de lo Corporal' (TPC | Pedagogical Treatment of the body sphere). From the analysis of the constrains and of the teaching conditions of each of its members, the aim of their work is to conduct educational practices of quality and the improvement of the coherence and explicitness of the theories in which they are based. The working dynamic that predominates in the seminar reflects, grosso modo, the logic of the action-research. In this context, this article shows the process followed around a 'unity of action-research', that is, the planning, development and assessment of a Didactic Unit (UD), selected at random from the annual PE program designed for a group of schoolchildren in their first course of primary education. The text attempts to show the full praxis of this mini-process; the collaborative work and the interdependencies between the two teachers involved, the researcher and the school PE teacher; the enrichment of cultural and professional background of its protagonists; and some indicators of the progress of children who attend PE lessons.
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