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Distribución y diversidad genética de Begomovirus que infectan tomate (Solanum lycopersicum L) en Colombia
Vaca-Vaca,Juan Carlos; Betancur-Pérez,Jhon Fredy; López-López,Karina;
Revista Colombiana de Biotecnología , 2012,
Abstract: diseased caused by begomoviruses (family geminiviridae) constitute a serious constraint to tomato production in colombia. however characterization of these new viruses had not been carried out so far. here we report a large scale survey on the distribution and genetic diversity of tomato infecting geminiviruses which are affecting mayor growing area of this crop in the country. viruses were detected by pcr using universal primers for members of genus begomovirus. the rflp analysis of pcr-amplified fragments showed individual and mixed infections of several geminiviruses in many of the samples. pcr-amplified fragments were cloned and sequenced. based on sequence comparations and phylogenetic analysis, the colombian geminivirus isolates were new world bipartite geminiviruses showing close relationship with pymv and tovev. by means of bioinformatic analysis of cis-acting elements (iterons) involved in dna replication of rep gene of colombian geminivirus isolates was possible to postulate possible pseudorecombinación events that could occur between them but also confirm the occurrence of mixed infections.
Distribución y diversidad genética de Begomovirus que infectan tomate (Solanum lycopersicum L) en Colombia
Vaca-Vaca Juan Carlos,Betancur-Pérez Jhon Fredy,López-López Karina
Revista Colombiana de Biotecnología , 2012,
Abstract: Título en ingles: Distribution and genetic diversity of tomato –infecting Begomovirus in Colombia Resumen: Las enfermedades causadas por los begomovirus, (Familia Geminiviridae) constituyen una serie limitante para la producción del tomate en Colombia. Sin embargo, la caracterización de estos virus no ha sido realizada al momento. Aquí presentamos los resultados de un muestreo a nivel nacional que buscaba conocer la distribución y diversidad genética de los geminivirus que están afectando el cultivo de tomate en Colombia. Los virus fueron detectados mediante PCR, empleando primer universales específicos para el género Begomovirus. Los fragmentos amplificados por PCR fueron sometidos a un análisis tipo RFLP cuyos resultados evidenciaron presencia de infecciones mixtas e individuales de geminivirus en la mayoría de las muestras recolectadas en campo. Los fragmentos amplificados por PCR fueron clonados y secuenciados. El análisis de secuencia y filogenético mostró que los aislados begomovirales colombianos eran gemininivirus bipartitas típicos del Hemisferio Occidental y que algunos eran variantes de PYMV y otros de ToTEV. Mediante el análisis de los elementos cis-regulatorios (iterones) presentes en el promotor del gen de la proteína asociada a replicación (Rep) de los begomovirus aislados es posible postular eventos de pseudorecombinación que podrían suceder entre ellos durante la ocurrencia de infecciones mixtas en tomate. Palabras claves: Geminivirus; Solanum licopersicum; PCR-RFLP; infecciones mixtas. Abstract: Diseased caused by begomoviruses (Family Geminiviridae) constitute a serious constraint to tomato production in Colombia. However characterization of these new viruses had not been carried out so far. Here we report a large scale survey on the distribution and genetic diversity of tomato infecting geminiviruses which are affecting mayor growing area of this crop in the country. Viruses were detected by PCR using universal primers for members of genus Begomovirus. The RFLP analysis of PCR-amplified fragments showed individual and mixed infections of several geminiviruses in many of the samples. PCR-amplified fragments were cloned and sequenced. Based on sequence comparations and phylogenetic analysis, the Colombian geminivirus isolates were new world bipartite geminiviruses showing close relationship with PYMV and ToVEV. By means of bioinformatic analysis of cis-acting elements (iterons) involved in DNA replication of rep gene of Colombian geminivirus isolates was possible to postulate possible pseudorecombinación events that could occur betwee
Búsqueda de genes de resistencia al pasador del fruto en poblaciones segregantes de tomate
Rodríguez Mora Diana Milena,Betancur-Pérez Jhon Fredy,Vallejo Cabrera Franco Alirio,Vaca-Vaca Juan Carlos
Acta Agronómica , 2010,
Abstract: Las estrategias de mejoramiento genético para encontrar resistencia al pasador del fruto, Neoleucinodes elegantalis, en tomate, Solanum lycopersicum L. se han basado en métodos tradicionales de introgresión genética por medio de retrocruzamiento. Sin embargo este proceso es largo y dispendioso. Debido a esta problemática, se utilizó la técnica molecular cDNA-AFLP para identificar genes involucrados en la resistencia a esta plaga en poblaciones segregantes de tomate, con el fin de identificar marcadores moleculares que puedan ser utilizados en futuros programas de fitomejoramiento. Los materiales de tomate evaluados fueron Unapal-Maravilla (susceptible), S. habrochaites var. glabratum, accesión PI 134418 (resistente) y tres retrocruzamientos obtenidos del cruzamiento interespecífico entre ambas especies. De estos materiales vegetales se extrajo el RNA total y se sintetizó el cDNA, el cual se utilizó como material de inicio de la técnica cDNA-AFLP. A partir del preamplificado de cDNA se evaluaron diferentes combinaciones de primers: +1+1, +3+3 y sus derivados. La combinación que presentó mejores amplificados fue la +1+1, para un total de 37 bandas polimórficas. De estas bandas, 9 fragmentos tipo EST (Expressed Sequence Target) fueron recuperados, siendo candidatos a explicar la resistencia al pasador del fruto en tomate.
Búsqueda de genes de resistencia al pasador del fruto en poblaciones segregantes de tomate
Rodríguez Mora,Diana Milena; Betancur-Pérez,Jhon Fredy; Vallejo Cabrera,Franco Alirio; Vaca-Vaca,Juan Carlos; López-López,Karina;
Acta Agronómica , 2010,
Abstract: breeding strategies for resistance to fruit borer neoleucinodes elegantalis in tomato solanum lycopersicum k l. have relied on traditional methods through genetic introgression by backcrossing. however, this process is slow and expensive. the cdna-aflp molecular technique was used to identify genes involved on fruit borer resistance in tomato segregating populations, the evaluated materials of tomato were: unapal maravilla (susceptible to fruit borer) , s. habrochaites var. glabratum, acc. pi 134418 (resistant to fruit borer), and three interspecific backcross produced by crossbreeding between those two species. from these plant materials, total rna was extracted and cdna-aflp technique was implemented. from the preamplified cdna, different combinations of primers: +1+1, +3+3 and their derivates were evaluated. the combination that showed better amplified was +1+1 for a total of 37 polymorphic bands and 9 fragments type expressed sequence target was isolated, which could explain the resistance of tomato to fruit borer.
El museo, la museología y la fuente de información museística
Linarez Pérez,Juan Carlos;
ACIMED , 2008,
Abstract: the training of information professionals requires an integrative vision that assesses the meaning and importance museums have had and still have. the history of the museums has evolved just as the history of humanity; the origin of the term mouseion, dates back to the worship to the muses in the old greek regions of tracia and beocia. in america, as opposed to europe, the museums consolidated the nationalist and historic feelings. museology is the field of knowledge that confers formality and scientific rigorousness to the museum activity. starting from the dimensions of analysis proposed by van mensch (1995), the most significant elements of museum knowledge can be established; nevertheless, these dimensions cannot be seen as an abstract atomization of the knowledge in museology; they are, on the contrary, complementary verifiable elements. while the theoretical-empirical approach is of an especially heuristic character, that of the functional rationality aims to the design of behavior strategies, whereas the critic-philosophical approach seeks to develop a definitive point of view of paradigmatic connotations.
Juicios y cambios políticos: una visión epistémica
Pérez Toribio,Juan Carlos;
Argos , 2009,
Abstract: as a result of the profound political upheavals that have been and continue to be witnessed in some latin american countries over the last few years, we attempt to show the difficulties involved in describing social events in such circumstances, giving rise to what we might call a conflict of interpretations. in this sense, we explore the epistemological and epistemic possibilities that should be taken into account to allow us to consider certain judgments as true or otherwise. we also stress the importance of values and language in terms of what are finally considered as "facts" after weighing up both the rationality and reasonableness that judgments should be provided with.
El museo, la museología y la fuente de información museística Museums, museology and the sources of museum information
Juan Carlos Linarez Pérez
ACIMED , 2008,
Abstract: La formación de profesionales de la información requiere de una visión integradora que valore la significación e importancia que han tenido y aún conservan los museos. La historia de los museos ha transcurrido en forma paralela con la historia de la humanidad. El origen del término mouseion, se remonta al culto que se rendía a las musas en las antiguas regiones griegas de Tracia y Beocia. En América, a diferencia de Europa, los museos sirvieron para el afianzamiento de los sentimientos históricos y nacionalistas. La museología se erige como campo del conocimiento que confiere formalidad y rigurosidad científica a la actividad museística. Partiendo de las dimensiones de análisis que propone van Mensch (1995), pueden establecerse los elementos más significativos del conocimiento museológico; sin embargo, estas dimensiones no pueden verse como una atomización abstracta del conocimiento en la museología; son, por el contrario, elementos que se complementan, verificables. En tanto la aproximación teórico-empírica es de carácter eminentemente heurístico, la de la racionalidad funcional apunta hacia el dise o de estrategias de comportamiento y la crítico-filosófica busca el desarrollo de un punto de vista definitivo de connotaciones paradigmáticas. The training of information professionals requires an integrative vision that assesses the meaning and importance museums have had and still have. The history of the museums has evolved just as the history of humanity; the origin of the term mouseion, dates back to the worship to the muses in the old Greek regions of Tracia and Beocia. In America, as opposed to Europe, the museums consolidated the nationalist and historic feelings. Museology is the field of knowledge that confers formality and scientific rigorousness to the museum activity. Starting from the dimensions of analysis proposed by van Mensch (1995), the most significant elements of museum knowledge can be established; nevertheless, these dimensions cannot be seen as an abstract atomization of the knowledge in Museology; they are, on the contrary, complementary verifiable elements. While the theoretical-empirical approach is of an especially heuristic character, that of the functional rationality aims to the design of behavior strategies, whereas the critic-philosophical approach seeks to develop a definitive point of view of paradigmatic connotations.
Las Bases Moleculares del Cáncer Las Bases Moleculares del Cáncer
Juan Carlos Raya Pérez
Acta Universitaria , 2012,
Abstract: El estudio del cáncer a nivel molecular ha permitido el descubrimiento de gran cantidad de genes mutados relacionados con esta enfermedad. Estos genes son supresores de tumores u oncogenes, que tienen con ver la proliferación celular, la metástasis y/o la capacidad de las células para inducir la vascularización del tejido. La búsqueda de terapias ha llevado al descubrimiento de muchas moléculas capaces de inhibir el crecimiento de las células cancerosas, aunque la mejor opción sigue siendo la revisión periódica y la prevención. Al parecer, pese a los avances, los marcadores moleculares fallan en un alto porcentaje al tratar de diagnosticar un cáncer, así como al tratar de dar un pronóstico. Esto podría deberse al hecho de que se esta abordando el problema a nivel de célula. Cancer research has allowed us to discover many genes implied in development of this disease. These genes are suppressors or oncogenes that participate in cellular proliferation, methastasis and/or capacity of cell to induce vascularization of the tissue. Also, it has allowed the discovery of molecules able to inhibit the growth of cells cancerous. However, periodic checkups continues to be the best prevention against cancer. At molecular level is difficult to diagnose it, perhaps because is necessary to go to the tissue level. Molecular markers are not yet a reliable method in order to obtain a diagnosis or forecast cancer, maybe because one forgets the tissue level.
La Estructura de la Cromatina y la Regulación de la Transcripción La Estructura de la Cromatina y la Regulación de la Transcripción
Juan Carlos Raya Pérez
Acta Universitaria , 2012,
Abstract: Transcription in eucaryotes is aprocess investigated with great interest because is one of the crucial steps to understand how the DNA information is transformed in a complex organism. In this paper some of the most important steps in the genetic transcription control are revised giving some illustrative examples. La transcripción en eucariotas son eventos a los que se les investiga con gran interés, pues es uno de los pasos cruciales para tratar de entender cómo la información del DNA es transformada en un organismo complejo. Aquí se revisan algunos de los pasos más importantes del control de la transcripción genética, haciendo énfasis en la estructura de la cromatina. Se dan algunos ejemplos ilustrativos.
El Fototropismo en Plantas El Fototropismo en Plantas
Juan Carlos Raya Pérez
Acta Universitaria , 2012,
Abstract: El estudio del fototropismo ha llevado al aislamiento del gen que codifica para la fototropina. También se ha logrado el aislamiento de otros genes relacionados, como nph4, nph3 y rpt2. Es de esperarse que en los próximos a os se establezca la vía de se alización en que participan las fototropinas, vías poco dilucidadas hasta ahora. Studies on the molecular basis of phototropism have led to the isolation of the phototropin gene. Others genes involved in the phototropic response such as nph4, nph3 and rpt2 have also been isolated. It isexpected that in the near future it will be established what is the participation of the phototropins, unknown until know, by means of signalling.
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