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ARN数据库:重组和可视化成脂调控网络信息
ARN: Recombination and Visualization of Adipogenesis Regulation Network Information
 [PDF]

,, 昝林森
Hans Journal of Computational Biology (HJCB) , 2016, DOI: 10.12677/HJCB.2016.61002
Abstract:
肥胖是工业化国家面临的巨大挑战。同时,许多代谢相关的疾病如糖尿病、动脉粥样硬化等也和脂肪的累积息息相关。因此,我们有必要深入理解成脂(脂肪组织形成的过程)的分子机制。然而,信息的碎片化严重阻碍着新的关键基因及通路的识别,于是我们想到要为专业的研究人员提供一个方便易用的成脂调控信息中心。在本研究中,我们通过文本挖掘技术辅以专业人员的人工检查和注释,整理收集来自PubMed数据库的1457篇与成脂分化相关的文章,搭建了一个公开的数据库平台——ARN数据库,截止到2016年2月25日,共收集到与成脂相关的3054个节点,1807条互作关系,10,675条表达记录,并通过miRGate、PAZAR和TRRUST等数据库确定了12,696条可能存在的靶向调控关系,为成脂研究领域的研究者提供了一个快速便捷的可视化信息中心。因此,这个平台将有助于研究者发现成脂调控中的重要基因和通路。
Excessive weight gain and obesity pose significant health challenges to many industrialized na-tions. Many metabolic disorders associated with cardiovascular diseases such as diabetes and atherosclerosis are directly linked to the increased production and size of adipose cells. Under-standing the molecular mechanism that underlies adipogenesis, the process by which adipose or fat tissue is formed, is thus of critical importance. However, the information fragmentation ham-pers the identification of key regulatory genes and pathways. Thus, it is necessary to provide an information center that is quickly and easily accessible to researchers in this field. In this study, we developed a publicly available database and web interface that serves as a resource for adi-pogenesis research. In ARN, nodes (genes and microRNAs) were collected using a text mining procedure followed by manual review and annotation by experts of this field. In total, 3054 nodes, 1807 relations, and 10,675 expression records associated with adipogenesis according to 1457 articles were collected (last update: 29 January 2016). Additionally, we further determined 12,696 possible relations of these nodes due to miRGate, PAZAR and TRRUST. Hence, this plat-form can support the ongoing adipogenesis research and contribute to discovery of key regula-tory genes and pathways.
芝田硫化叶菌SSV1病毒DNA复制的诱导
刘丹旭,
科学通报 , 2002,
Abstract: 芝田硫化叶菌(Sulfolobus shibatae)是一种极端嗜热古菌,其所携带的温和病毒SSV1是研究古菌DNA复制的一个非常合适的系统,杂交分析表明,静置培养时,芝田硫化叶菌细胞内几乎检测不到游离SSV1DNA,病毒DNA主要以整合状态存在。经紫外或丝裂霉素诱导后,细胞内游离SSV1DNA含量明显增加,但整合SSV1DNA拷贝数不变,丝裂霉素诱导作用的重复性明显高于紫外诱导,另外,当细胞由静置培养改为摇床培养时,SSV1DNA也被诱导复制,据此,建立了SSV1DNA复制的丝裂霉素诱导方法。采用此法,芝田硫化叶菌细胞内游离SSV1DNA含量在诱导后10h开始明显增加,并在12-15h达到最大值,诱导后细胞内游离病毒DNA的拷贝数可达到50,上述诱导方法的建立以及对诱导后SSV1DNA复制行为的描述为确定SSV1病毒DNA的复制原点,分析其复制模式奠定了基础。
离散常系数线性系统部分变元稳定性的充分必要条件

科学通报 , 1991,
Abstract: 本文研究离散常系数线性系统: (1) =0,1,2,……对变元x_1…,X_m(m
考虑流体效应的船-桥碰撞数值模拟法研究
,
工程力学 , 2015, DOI: 10.6052/j.issn.1000-4750.2014.01.0056
Abstract: 有别于传统的不考虑流体对被撞桥墩影响的船-桥碰撞问题,该文在动水压力计算的基础上,建立了考虑流体效应的船-桥碰撞的附加质量计算模型,并与流构耦合计算模型以及不考虑流体影响的计算模型在能量转换、碰撞力、船艏撞深、桥墩位移、应力、截面内力以及计算效率等方面的结果进行了比较分析。结果表明:流体对船艏碰撞力影响较小,但能降低船舶的损毁程度;流构耦合计算模型中的墩顶水平位移响应要略小于附加质量模型和不考虑流体影响时的计算结果;不同计算模型所得桥墩有效应力基本相同且具有相同的分布规律;船-桥碰撞附加质量模型在计及流体与结构相互作用的同时,具有较高的精度和计算效率。
稳定系统的二次型V函数的存在性

科学通报 , 1989,
Abstract: 考虑Lyapunov矩阵方程A~TB+BA=-C,(1)(A,B,C∈R~(n×n),B~T=B,C~T=C)与线性定常系统x=Ax.(2)本文研究当系统(2)之零解稳定时,对
常系数线性系统部分变元稳定性的判别

科学通报 , 1984,
Abstract: 考虑n阶常系数线性方程组其中y∈R~m,z∈R~p,m+p=n,T、A、B、C、D是常数矩阵。方程组(1)对变元y的渐近稳定性除可从直接求解进行判别外,目前已有苏联学者发表的线性变换方法。我们从分析矩阵T与D的关系得到以下结
芝田硫化叶菌SSV1病毒DNA复制的诱导
刘丹旭,
科学通报 , 2002,
Abstract: 芝田硫化叶菌(Sulfolobusshibatae)是一种极端嗜热古菌,其所携带的温和病毒SSV1是研究古菌DNA复制的一个非常合适的系统.杂交分析表明,静置培养时,芝田硫化叶菌细胞内几乎检测不到游离SSV1DNA,病毒DNA主要以整合状态存在.经紫外或丝裂霉素诱导后,细胞内游离SSV1DNA含量明显增加,但整合SSV1DNA拷贝数不变.丝裂霉素诱导作用的重复性明显高于紫外诱导.另外,当细胞由静置培养改为摇床培养时,SSV1DNA也被诱导复制.据此,建立了SSV1DNA复制的丝裂霉素诱导方法.采用此法,芝田硫化叶菌细胞内游离SSV1DNA含量在诱导后10h开始明显增加,并在12~15h达到最大值.诱导后细胞内游离病毒DNA的拷贝数可达到50.上述诱导方法的建立以及对诱导后SSV1DNA复制行为的描述为确定SSV1病毒DNA的复制原点、分析其复制模式奠定了基础.
离散常系数线性系统部分变元稳定性的充分必要条件

科学通报 , 1991,
Abstract: 本文研究离散常系数线性系统(1)=0,1,2,……对变元x_1…,X_m(m
关于矩阵方程A~TB+BA=—C的一个新结果

科学通报 , 1988,
Abstract: 方程(1)的解的情况较复杂(即非唯一解),迄今少有研究结果。关于方程(1)的非唯一解,有重要意义的问题之一是与常系数线性系统
从基督教史看主流价值文化的道义性问题

华东师范大学学报(哲学社会科学版) , 2012,
Abstract: 基督教之所以经历了“边缘—中心—边缘”的转换过程,原因在于文化的价值取向。罗马帝国精神世界有两大特征,一是物欲化,一是空洞化,这成为基督教得以传播和取得统治地位的历史条件。基督教的胜利表明一个政治构架的维系,需要能够提供道义崇高性的主流文化。中世纪的基督教复制了当年罗马帝国的腐朽,终而以道义的崇高兴,又以道义的失落衰。无论一个社会的实际状态如何,它的存在总是需要道义性支持的,这是主流文化构建的基本规律。
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