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草莓果实不同发育阶段抑制差减文库(ssh)的构建及相关基因的表达分析
周厚,李刚,王子,郭蔼光
农业生物技术学报 , 2013,
Abstract: ?寻找控制草莓果实硬度、成熟软化和褐化等性状相关基因并进行有效的调控具有现实意义,本研究分别以丰香草莓(fragaria×ananassaduch.cv.toyonoka)果实大绿果期和转色期两个发育阶段的cdna为实验组(tester)和驱动组(driver),利用抑制差减杂交(suppressionsubtractionhybridization,ssh)技术构建了正反两个cdna文库,分别包含516和524个克隆。通过est测序、序列拼接后,共获得707条uniests,其中正反向文库分别为369和338个非冗余序列(uniests),包括123条拼接序列(contigs)和584条单一序列(singletons)。在nt库比对中有537条uinests与已知基因匹配,占比75.95%;在nr库比对中有509条序列有匹配蛋白,占比71.99%。有193个uniests能进行geneyontology(go)功能注释,其中细胞组分被注释了315次、分子功能被注释了332次、生物过程被注释了409次。uniests的功能分析显示,绿果期文库多数与细胞营养生长、分裂、早期胚胎发育和营养运输有关,转色期文库主要与刺激代谢物形成、色素合成、果实软化和种子成熟有关,与草莓果实发育和成熟生理过程基本一致。采用qrt-pcr对果实成熟相关蛋白(putativeripening-relatedprotein)、多聚半乳糖醛酸酶(polygalacturonase,pg)、myb转录因子(mybtranscriptionfactor,myb)、类异黄酮还原酶(isoflavonereductase-likegene,irl)、胚胎发育晚期丰富蛋白(laterembryoabundantprotein,lea)、乙烯受体etr1(ethylenereceptoretr1)等6个基因在草莓果实发育、成熟期在根、叶、花中的表达模式进行了分析,研究结果为进一步研究草莓果实发育和成熟机制提供基础资料。
表观遗传与花期调控研究进展
朱芹芹,李忠爱,何艳,文淇,王子
园艺学报 , 2013,
Abstract: 目前,关于高等植物成花机理的研究已经取得突破性进展,对表观遗传的研究也越来越深入,而将两者联系起来调控花期的研究虽然还处于初步探索阶段,但已取得了一定的理论成果。本文总结了常见的表观遗传(dna甲基化、组蛋白修饰、非编码rna、染色质重塑)在不同开花诱导途径中调控花期的研究进展,为通过表观遗传途径调控花期技术研究提供参考。
拟南芥幼苗超低温保存后DNA甲基化的遗传变异
何艳;王子*
植物学报 , 2009, DOI: 10.3969/j.issn.1674-3466.2009.03.008
Abstract: ?运用MSAP技术分析了拟南芥(Arabidopsisthaliana)幼苗超低温保存后DNA甲基化的遗传变异情况。结果表明,在扩增的662条带中,对照和2个处理及其第2代间完全一致的带型有598条;发生变化的带型有64条,其中能遗传给第2代的有48条,占变异条带的75%。与对照相比,经超低温保存的样品新产生的甲基化位点有14个,而去甲基化的位点有22个。经过处理但未冷冻的与冷冻处理组之间带型一致的有624条,差异条带有38条,占5.7%,而对照与未冷冻处理组的差异率是7.45%,对照与冷冻处理组之间的差异率是6.63%。可见,拟南芥在超低温保存中,无论是经液氮冷冻还是未经冷冻处理,对材料的甲基化状态均有影响,而这种甲基化变化大部分是可以遗传的。
土霉素胁迫下拟南芥基因组dna甲基化的msap分析
杜亚琼?,王子,
生态学报 , 2011,
Abstract: 以拟南芥(arabidopsisthaliana)为材料,研究不同土霉素浓度下拟南芥幼苗生长发育及基因组dna的甲基化水平和变化模式。结果表明,3、5、7\,9μmol/l土霉素胁迫对拟南芥幼苗的根长和株高有显著抑制作用;但对拟南芥幼苗的侧根数量有显著促进作用。甲基化敏感扩增多态性(methylation-sensitiveamplificationpolymorphism,msap)分析表明,经3、5、7\,9μmol/l土霉素处理后基因组dna甲基化比率分别为17.91%、12.50%、11.81%和14.62%,均低于对照(18.18%)。结果表明,拟南芥经土霉素胁迫后存在基于dna甲基化水平和模式改变的表观遗传变异,5-甲基胞嘧啶百分含量的变化无统一趋势或规律。与对照相比,3、5、7\,9μmol/l土霉素胁迫下拟南芥幼苗基因组dna的甲基化和去甲基化分别为13.29%、9.22%、8.03%、12.59%和2.80%、4.26%、5.11%、4.90%。由此推测,dna甲基化可能是植物适应土霉素胁迫机制的机制之一。
流体饱和多孔介质黏弹性动力人工边界
王子,,董亮
力学学报 , 2006, DOI: 10.6052/0459-1879-2006-5-2005-403
Abstract: 基于Biot流体饱和多孔介质本构方程,分别考察具有辐射阻尼性质的外行柱面波和球面波在圆柱面和球面人工边界上引起的法向、切向应力的表达式.在应力表达形式上,固相介质和孔隙流体的法向和切向应力都是由两项组成,它们分别与质点的位移和速度成正比,因此,可在人工边界的法向和切向设置连续分布的并联弹簧------黏滞阻尼器,用来模拟人工边界以外的无限域介质对来自有限计算域的外行波动的能量吸收作用,从而形成了流体饱和多孔介质的黏弹性动力人工边界.流体饱和多孔介质的黏弹性动力人工边界可方便地与大型通用软件结合,用于分析饱和土中复杂的结构-地基动力相互作用问题.算例表明流体饱和多孔介质黏弹性动力人工边界具有较好的精度和稳定性.
Variation of DNA Methylation in Arabidopsis thaliana Seedlings After the Cryopreservation
拟南芥幼苗超低温保存后DNA甲基化的遗传变异

Yanxia He,Zicheng Wang,
何艳
,王子

植物学报 , 2009,
Abstract: We analyzed the variation patterns of DNA methylation in Arabidopsis thaliana seedlings after cryopreservation using methylation-sensitive amplified polymorphism. Of 662 fragments, 598 were shared by all the samples and their descendants; and among 64 different fragments, a varied 48 (75%) were genetically related to their descendants. Compared to the control, 14 sites showed de novo methylation, and 22 sites were demethylated in the samples after cryopreservation. Among samples treated with cryoprotection and after cryopreservation were 624 shared fragments and 38 fragments of difference, with 7.45% and 6.63% difference in the two treatment samples, respectively, as compared with the control. In conclusion, the results showed that whether cryostorage in liquid nitrogen or other treatments had impact on the DNA methylation states of the material in this study, and most of the change could be genetic to their descendants.
菊花组织培养继代过程中的dna甲基化变化
聂丽娟,王子,何艳
园艺学报 , 2008,
Abstract: 采用msap(甲基敏感扩增多态性)方法对菊花(dendranthema×grandiflorum)组织培养继代过程中的dna甲基化情况进行了分析。结果发现,3个单芽系的组培苗较田间材料均有dna甲基化增加和减少现象,采用7对引物,共扩增出929条带,各单芽系dna甲基化变异率分别为8.929%、8.902%和8.986%。继代材料较母体均有甲基化变异发生,且变异类型中dna甲基化减少的比例高于甲基化增加的比例,随着继代次数的增加,两种变异间的差异逐渐减小,比例相近。同时在同一单芽系内的不同次继代个体间有dna甲基化变化现象,对5次继代的180个个体研究发现,带型变化中18.38%的带型不一致,2.99%为一个或两个个体发生了变化,仅有1.72%在发生变化后趋于稳定,另外10.68%的带型呈现不稳定的随机变化。
离体条件下5-氮杂胞嘧啶核苷对菊花dna甲基化和表型性状的影响
王子,聂丽娟,何艳
园艺学报 , 2009,
Abstract: 采用离体处理的方法,初步研究了5-氮杂胞嘧啶核苷(5-azac)对菊花的影响。结果表明,500μmol·l-1以上时有致死效应,100μmol·l-1以上时能抑制离体材料的生长发育,而各浓度对菊花的丛生芽均具有抑制作用,且这种抑制作用具有时间累加效应和剂量累计效应。10μmol·l-1以下时使菊花开花时间有不同程度的提早,这一效应具有稳定性,并可通过营养繁殖进行遗传。msap技术分析表明,处理材料基因组dna甲基化水平明显降低,在去处理后的继代过程中仍有部分位点保持低甲基化状态。
北小麝鼩的代谢产热和体温调节特征
王子,管淑君,杨明,,
兽类学报 , 2010,
Abstract: ?为探讨食虫目小型哺乳动物的代谢产热和体温调节特征,本文采用封闭式流体压力呼吸仪测定了北小麝鼩在环境温度5~30℃下的静止代谢率(rmr),结果显示:在环境温度(ta)为175~25℃的范围内,北小麝鼩的体温基本维持恒定,平均体温为36.55±0.38℃;热中性区(tnz)为20~25℃;基础代谢率bmr为5.46±0.23(mlo2/g·h),其中环境温度在25℃时静止代谢率最低,为4.84±0.39(mlo2/g·h)。在5~25℃环境温度范围内,热传导值保持稳定;在此温度范围内,北小麝鼩的热传导率(c)最低,平均为0.42±0.01mlo2/(g·h·℃)。总之,北小麝鼩的产热和体温调节特征为较高的bmr,中等的热传导率,较低的体温和较宽的热中性区。这些特征可能与该物种体型小、夜行性、主要以无脊椎动物为食等生活习性密切相关。
不同介质互层分布的弹性半空间地震波场输入
王子,,李伟华,徐春铃
岩石工程学报 , 2006,
Abstract: 基于biot两相饱和多孔介质动力学理论,提出两相饱和多孔介质与单相固体介质互层弹性半空间地震波场解析计算方法,为两相饱和多孔介质和单相固体介质互层分布弹性半空间中的地下结构的地震波场输入提供理论基础。
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