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ISSN: 2333-9721

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基于网络特征的药物靶蛋白识别
朱明珠,高磊,李霞,刘志成
中国科学 生命科学 , 2008,
Abstract: 蛋白质很少孤立得发挥作用,往往通过网络中彼此互作来共同行使功能.因此分析药物靶蛋白在生物学网络中的性质将十分有助于从信息学角度理解药物的作用机制.但目前尚无研究对药物靶蛋白在人类蛋白质互作网络中的拓扑特性给与具体的分析和描述.本文首先将药物靶蛋白映射到人类蛋白质互作网络中,进而分析了药物作用靶蛋白在互作网络中的5种拓扑指标,并与互作网络中全蛋白质组集合及非药物靶点集合的拓扑指标进行了对比.结果显示,药物靶蛋白之间具有更高的连通性,信息能够得到更快得传递.基于这些拓扑特征,将互作网络中的所有蛋白进行排序.发现排序在前100位的蛋白中有48个是Drugbank中记录的药物靶点,另外的52个蛋白中有9个蛋白已在TTD,Matador等数据库中被记录为药物靶点,还有部分蛋白通过文献检索被证实为药物靶点.
基于网络特征的药物靶蛋白识别
朱明珠,高磊,李霞,刘志成
中国科学 生命科学 , 2008,
Abstract: 蛋白质很少孤立得发挥作用,往往通过网络中彼此互作来共同行使功能.因此分析药物靶蛋白在生物学网络中的性质将十分有助于从信息学角度理解药物的作用机制.但目前尚无研究对药物靶蛋白在人类蛋白质互作网络中的拓扑特性给与具体的分析和描述.本文首先将药物靶蛋白映射到人类蛋白质互作网络中,进而分析了药物作用靶蛋白在互作网络中的5种拓扑指标,并与互作网络中全蛋白质组集合及非药物靶点集合的拓扑指标进行了对比.结果显示,药物靶蛋白之间具有更高的连通性,信息能够得到更快得传递.基于这些拓扑特征,将互作网络中的所有蛋白进行排序.发现排序在前100位的蛋白中有48个是Drugbank中记录的药物靶点,另外的52个蛋白中有9个蛋白已在TTD,Matador等数据库中被记录为药物靶点,还有部分蛋白通过文献检索被证实为药物靶点.
暴力 迷宫 镜子---- 博尔赫斯小说意象的精神分析
明珠
湖南工业大学学报(社会科学版) , 2008,
Abstract: 暴力、迷宫及镜子是博尔赫斯小说中经常出现的文学意象, 也是跟随他多年的三个噩梦。阅读博尔赫 斯传记会发现它们和他的童年生活密切相关。精神分析学理论认为, 作家的创作是对无意识及童年受压抑欲 望的反应。据此, 用精神分析学理论解读博尔赫斯小说, 为理解其人其小说打开了一扇门户。
南水北调中线工程建设资金安全监管实践
明珠
人民长江 , 2015,
Abstract: ?为确保南水北调中线水源工程建设的资金安全,中线水源公司认真履行业主职能,严格执行国家有关财经政策并结合工程建设实际,出台了多项建设资金管理规定,如:严格银行开户制度;明确财务人员岗位职责,建立制衡机制;科学设立会计科目,建立成本核算制度等。从业务范围上明确了公司财务人员相应分工,划分了不同的会计岗位;同时,按国家财经法规有关制度的要求,赋予不同岗位人员一定权限。详细介绍了建设资金的监管过程,可供同类工程参考。
结合蛋白质互作与基因表达谱信息大范围预测蛋白质的精细功能
高磊,李霞,郭政,朱明珠,李彦辉,饶绍奇
中国科学 生命科学 , 2006,
Abstract: GESTs(gene expression similarity and taxonomy similarity)是结合基因表达相似性和基因功能分类体系Gene Ontology(GO)中的功能概念相似性测度进行功能预测的新方法.将此预测算法推广应用于蛋白质互相作用数据,并提出了几种在蛋白质互作网络中为功能待测蛋白质筛选邻居的方法.与已有的其它蛋白质功能预测方法不同,新方法在学习过程中自动地从功能分类体系中的各个功能类中选择最合适的尽可能具体细致的功能类,利用注释于其相近功能类中的互作邻居蛋白质支持对此具体功能类的预测.使用MIPS提供的酵母蛋白质互作信息与一套基因表达谱数据,利用特别针对GO体系结构层次特点设计的3种测度,评价对GO知识体系中的生物过程分支进行蛋白质功能预测的效果.结果显示,利用文中的方法,可以大范围预测蛋白质的精细功能.此外,还利用此方法对2004年底Gene Ontology上未知功能的蛋白质进行预测,其中部分预测结果在2006年4月发布的SGD注释数据中已经得到了证实.
结合蛋白质互作与基因表达谱信息大范围预测蛋白质的精细功能
高磊,李霞,郭政,朱明珠,李彦辉,饶绍奇
中国科学 生命科学 , 2006,
Abstract: GESTs(geneexpressionsimilarityandtaxonomysimilarity)是结合基因表达相似性和基因功能分类体系GeneOntology(GO)中的功能概念相似性测度进行功能预测的新方法.将此预测算法推广应用于蛋白质互相作用数据,并提出了几种在蛋白质互作网络中为功能待测蛋白质筛选邻居的方法.与已有的其它蛋白质功能预测方法不同,新方法在学习过程中自动地从功能分类体系中的各个功能类中选择最合适的尽可能具体细致的功能类,利用注释于其相近功能类中的互作邻居蛋白质支持对此具体功能类的预测.使用MIPS提供的酵母蛋白质互作信息与一套基因表达谱数据,利用特别针对GO体系结构层次特点设计的3种测度,评价对GO知识体系中的生物过程分支进行蛋白质功能预测的效果.结果显示,利用文中的方法,可以大范围预测蛋白质的精细功能.此外,还利用此方法对2004年底GeneOntology上未知功能的蛋白质进行预测,其中部分预测结果在2006年4月发布的SGD注释数据中已经得到了证实.
加速度,挠率与点的空间曲线运动
朱明
力学与实践 , 1983,
Abstract: 点作空间曲线运动时,速度V=dr/dt=ds/dt,加速度a=a_ττ+a_nn,a_b恒为0,速度、加速度永远在密切面内,但为何点又离开密切面作空间曲线运动呢?为了较深入地认识这个问题,不妨引入加加速度的概念,这与空间曲线的挠率有关并与力的导数户相联系。由微分几何中有Frenet公式:
国际多体系统动力学讨论会
朱明
力学进展 , 1987, DOI: 10.6052/1000-0992-1987-1-J1987-018
Abstract: 多体系统动力学是自60年代开始发展起来的。随着航天工业及机械工业的发展,高速、高精度机构的出现,对系统的设计提出更高的要求,需要有更正确的模型来描述真实系统。这就导致多体系统有较复杂的数学模型及较多的自由度。而计算机的出现及发展,又为解决这样复杂的系统提供了强有力的工具。因而多体系统动力学20年来已取得了可喜的成果。继1977年由国际理论与应用力学联合会(IUTAM)主持举行了第1次国际多体系统动
加速度,挠率与点的空间曲线运动
朱明
力学与实践 , 1983, DOI: 10.6052/1000-0992-1983-113
Abstract: 点作空间曲线运动时,速度V=dr/dt=ds/dt,加速度a=a_ττ+a_nn,a_b恒为0,速度、加速度永远在密切面内,但为何点又离开密切面作空间曲线运动呢?为了较深入地认识这个问题,不妨引入加加速度的概念,这与空间曲线的挠率有关并与力的导数户相联系。由微分几何中有Frenet公式...
中世纪晚期巴黎的王权与城市
朱明
华东师范大学学报(哲学社会科学版) , 2014,
Abstract: 14世纪瓦卢瓦王朝开始,法国国王越来越将巴黎作为自己权力的展现场所,这与当时的政治环境密切相关,内外交困使瓦卢瓦朝国王迫切寻求权力的合法性。空间成为一种策略,通过建筑、艺术、仪式以及城市规划,表现出王权对城市空间的控制,从而增强自身的权威,巩固王朝的统治。权力符号与空间要素的紧密结合,体现出中世纪城市与政治密切结合的特征,城市成为权力场所。
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