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亲水相互作用色谱结合串联质谱多重碎裂模式在完整糖肽研究中的应用
江静,,钱小红
分析化学 , 2014, DOI: 10.3724/SP.J.1096.2014.30310
Abstract: 蛋白质的糖基化修饰在生理及病理过程中发挥着重要作用。由于技术条件的限制,传统的糖蛋白分析方法中,通常分别鉴定蛋白质和糖链两者的结构,而忽略了蛋白质与糖链的连接关系。本研究旨在以完整糖肽作为检测对象,对糖肽中肽段序列和糖链结构的同步解析。采用亲水相互作用色谱对完整糖肽进行分离纯化,联合生物质谱中碰撞诱导解离(CID)、高能诱导解离(HCD)、电子转移解离(ETD)等裂解模式,对完整糖肽的糖基化位点、糖链结构、肽段序列等进行全方面的解析。结果表明,亲水相互作用色谱中样品与填料比1:50可有效富集糖肽,采用30%CID能量,主要产生糖苷键断裂的碎片,为糖链的结构组成分析提供了线索;采用25%HCD能量,在低分子量区域提供了糖链的特征离子信息,并产生明确的糖肽Y1特征离子;ETD保留了完整的修饰基团而产生肽段骨架的断裂,可以提供有效的肽段序列信息。本研究结合亲水相互作用色谱与质谱仪中的多种碎裂方式,为完整糖肽的结构解析提供了一种快速、有效的研究方案。
蛋白质组技术的研究进展
杨何义,,钱小红
自然科学进展 , 2002,
Abstract: 基因组学的研究已从结构基因组学转移到功能基因组学上来.以大规模分析蛋白质作为其主要内容的蛋白质组是功能基因组学研究的一个主要内容.综述了蛋白质组研究所使用的主要技术,包括:二维凝胶电泳技术、质谱技术、蛋白质芯片技术、蛋白质复合物纯化技术、酵母双杂交技术、嗜菌体显示技术.
蛋白质组学研究中傅立叶变换离子回旋共振质谱数据采集方法的比较
曾家伟,贾伟,,钱小红
分析化学 , 2010,
Abstract: 探讨了线性离子阱-傅立叶变换离子回旋共振质谱(LTQ-FT)的数据采集模式对蛋白质组鉴定结果的影响,比较和分析了针对不同复杂程度样本的最佳采集模式。对于α-乳清蛋白4种标准蛋白质酶切肽段混合物的简单体系,在傅立叶变换离子回旋共振腔中选3个最强母离子进行选择离子监测扫描后,再实施二级碎裂的方法(SIM3)得到的肽段覆盖率,分别是直接选10个最强母离子进行二级碎裂(FT10)方法得到的肽段覆盖率的1.5~1.9倍。另外,对酵母蛋白酶切肽段混合物的复杂体系鉴定时,只采集双电荷和三电荷母离子进行二级扫描的方法(FT10_23)比单电荷、双电荷和三电荷都采集的方法(FT10_23)得到的图谱鉴定成功率提高64.1%。实验还对不同数据采集模式下图谱的特点进行了考察。本研究表明,针对不同复杂程度的样本,应采取不同的质谱数据采集方法。
螯合稀土金属标记蛋白质技术的建立与优化
米薇,王晶,,蔡耘,钱小红
分析化学 , 2010,
Abstract: 建立了一种基于螯合稀土金属标记蛋白质的技术,优化了影响标记效率的各种条件。在50mmol/LTEAB缓冲体系(pH7.5),DTPA与肽段摩尔比为100:1,常温反应30min的条件下,DTPA标记完全;在100mmol/L乙酸铵缓冲液(pH6.0),稀土金属与DTPA摩尔比为4:1,37℃反应1h的条件下,稀土金属螯合反应完全。考察了不同稀土金属的螯合效率,发现离子半径最小的Lu螯合效率最高。本方法被成功应用于肽混合物标记。
求解一类凸多目标规划最小弱有效解的填充函数法
A Filled Function Method of Finding Weak Efficient Mi-nimizer for Convex Multi-Objective Optimization
 [PDF]

张莹,
Pure Mathematics (PM) , 2011, DOI: 10.12677/pm.2011.12029
Abstract:
针对一类目标函数为凸向量值函数且约束为箱子集的多目标规划,先利用线性加权和法将其转化为非凸单目标规划,再利用填充函数法求得该单目标规划的全局最优解,从而得到原规划的最小弱有效解。
To a kind of multi-objective optimization problem, which objective function is convex vector function and which constraints are box sets, firstly we use linear weighted method to turn it into nonconvex single-objective optimization problem, secondly we get the global minimizer of the single-objective optimi-zation problem by implying the filled function method, then we attain the weak efficient minimizer of the prime multi-objective optimization problem.
Smad3基因剔除致骨关节炎小鼠血清蛋白质组双向凝胶电泳分析
郝振明,杨晓,,王杰,钱小红,黄翠芬
生物工程学报 , 2002,
Abstract: Smad3基因剔除导致小鼠骨关节炎。为了进一步深入研究Smad3基因缺失导致骨关节炎形成的分子机制,寻找骨关节炎发生早期的分子变化。用双向电泳技术结合肽质量指纹谱技术对Smad3基因剔除小鼠和野生型小鼠血清蛋白质组进行了初步分析。对其中7个表达差异蛋白质进行了鉴定,并探讨了所鉴定蛋白质与骨关节炎发生的关系。为揭示SMAD3介导的TGF-β信号在骨骼发育中的重要作用提供了线索。 
Two-Dimensional Electrophoresis Separation Technique in Proteome Research
蛋白质组研究中的二维电泳分离技术

李蕾,,杨何义,蔡耘,钱小红
色谱 , 2003,
Abstract: 对目前生命科学研究中的热点领域蛋白质组研究中应用的主要分离技术二维聚丙烯酰胺凝胶电泳的基本原理、应用和最新进展进行了综述。同时,针对二维凝胶电泳的缺陷,介绍了目前正在发展的几种替代技术。
应用超高分辨双向凝胶电泳技术进行正常人类肝脏蛋白质组研究
米薇, 刘新, 贾伟, 李蕾, 蔡耘, , 钱小红
中国科学 生命科学 , 2010,
Abstract: 肝脏是人体最大的实质器官,承担着人体许多关键的生理功能,在生命活动中占有重要地位.根据人类肝脏蛋白质组计划,本实验旨在构建人肝脏蛋白质双向凝胶电泳表达谱,尽可能分离和鉴定更多的蛋白.在双向凝胶电泳第一向等电聚焦水平上,从上样方式、水化液配方、聚焦时间等方面优化了碱性蛋白的分离条件,利用超放大胶分离技术搭建了高分辨的双向凝胶电泳分离平台,构建了人类肝脏蛋白质2-DE参考谱,检测到5481个蛋白质点.这是目前国际上最为全面的人体器官蛋白质组2-DE参考谱,为其他肝病的研究提供了较好的参照系.成功鉴定了429个非冗余蛋白,对pH4.0~7.0,5.0~6.0,5.5~6.7,6.0~9.0部分蛋白质点在胶上进行了注释,由此构建了人肝2-DE蛋白质表达谱数据库.对蛋白质的理化性质、功能及亚细胞定位进行了全面分析.研究中构建的人类肝脏蛋白质2-DE图谱将为肝脏比较蛋白质组学研究提供参考.
改进的18O同位素标记法标记蛋白质多肽
赵焱,卢庄,贾伟,,钱小红
分析化学 , 2010,
Abstract: 针对18O同位素标记反应两个重要影响因素——肽段分散度和胰酶灭活方法,进行了标记条件的改进和灭活方法的优化。在H218O中加入RapigestTMSF助溶剂并微波辅助加热,使α-酪蛋白胰酶酶切肽段的标记效率得到明显改进(18O/16O峰面积比值>99%)。标记后,对胰酶进行还原烷基化化学修饰彻底灭活,使标记后的肽段稳定性显著提高,放置6d不发生回交反应。对标准蛋白质甲状腺球蛋白酶切肽段混合物标记后的质谱实验结果表明:优化的标记方法能快速稳定地标记蛋白质酶切多肽。
基于母离子排除的串联质谱数据采集方法的研究
米薇,王晶,,贾伟,蔡耘,钱小红
分析化学 , 2010,
Abstract: 生物样本中的蛋白质复杂程度很高,尚无一种分析方法能够全面分析复杂生物样本中的所有蛋白质。实验证明:重复的质谱分析能增加蛋白质的鉴定数量,但鉴定到的蛋白质冗余度很高,高丰度肽段被反复检出。为了降低鉴定冗余度,提高鉴定效率,对线性离子阱-傅立叶变换离子回旋共振质谱仪的串联质谱采集方法进行了研究,建立了基于母离子排除的串联质谱采集方法。此方法能极大降低二级质谱采集的冗余度,提高蛋白质的鉴定效率。
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