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Efficient K-medoids clustering algorithm
一种高效的K-medoids聚类算法

夏宁霞,苏一丹,覃希
计算机应用研究 , 2010,
Abstract: Due to the disadvantages of sensitivity to the initial selection of the medoids and poor performance in large data set processing in the K-medoids clustering algorithm, this paper proposed an improved K-medoids algorithm based on a fine-tuned of initial medoids and an incremental candidate set of medoids. The proposed algorithm optimized initial medoids by fine-tu-ning and reduced computational complexity of medoids substitution through expanding medoids candidate set gradually. Expenrimental results demonstrate the effectiveness of this algorithm,which can improve clustering quality and significantly shorten the time in calculation compared with the traditional K-medoids algorithm.
IC-kmedoids:适用于RNA二级结构预测的聚类算法
IC-kmedoids: A Clustering Algorithm for RNA Secondary Structure Prediction

王常武,刘小凤,王宝文,刘文远
- , 2015, DOI: 10.7507/1001-5515.20150018
Abstract: 采用自由能方法预测RNA二级结构时, 如何精确有效地从次优结构中筛选出真实的二级结构成为RNA结构预测中的关键。采用聚类技术对次优结构集合进行分析, 可有效地提高预测结果的精度。本文利用RBP分数矩阵, 提出一种基于增量中心候选集的改进k-medoids算法。它将随机选择初始中心并进行首次划分后以中心候选集逐一扩展的方式进行中心轮换, 以降低算法的复杂度。实验表明, 该算法能取得更高的CH值, 且能有效地缩短计算时间。
Due to the minimum free energy model, it is very important to predict the RNA secondary structure accurately and efficiently from the suboptimal foldings. Using clustering techniques in analyzing the suboptimal structures could effectively improve the prediction accuracy. An improved k-medoids cluster method is proposed to make this a better accuracy with the RBP score and the incremental candidate set of medoids matrix in this paper. The algorithm optimizes initial medoids through an expanding medoids candidate sets gradually.The predicted results indicated this algorithm could get a higher value of CH and significantly shorten the time for calculating clustering RNA folding structures.
面状水系伪增量剔除的拓扑量化法
林艳,陈军,刘万增,李佳田
武汉大学学报(信息科学版) , 2012,
Abstract: ?针对定量过滤法剔除伪增量时存在的真增量被过度过滤、伪增量不能完全过滤等缺陷,结合国家1∶5万数据库更新工程的实际需求,提出一种新的伪增量剔除方法——拓扑量化法,主要思想是结合拓扑空间关系判断与缓冲区量化分析来识别伪增量,进而得到更加准确的增量信息。
基于三差观测量的实时动态gps周跳修复方法研究
王贵文 王泽民 殷海涛
武汉大学学报(信息科学版) , 2007,
Abstract: ?提出了一种适用于实时动态周跳修复的方法。该方法利用多普勒观测值(或伪距),包括产生候选值、筛选候选值、确定候选值3个步骤。与已有的方法相比,该方法无需对观测值进行预报,适用于连续周跳的探测。理论推导和试验结果表明,在发生连续周跳时该方法能够探测出所有的周跳。
中国GDP增量与能源消费增量关系的多尺度分析
杜建丽,林振山,张真真,张彦龙
地理科学进展 , 2009, DOI: 10.11820/dlkxjz.2009.01.016
Abstract: 能源是一个国家经济增长和社会发展的重要物质基础,经济的发展和能源的利用有着密不可分的关系。本文用EMD方法首次对我国GDP增量和能源消费增量之间的关系进行比较分析,以期从一个崭新的途径上来揭示GDP增量波动周期与能源消费增量波动周期的相互关系,进而揭示GDP和能源消费之间的关系,从而为社会经济的长远规划、能源发展战略以及有关政策法规的制定提供一定依据。研究结果表明我国GDP增量的波动周期为4年、11年、18年和31年;能源消费增量的波动周期为4年、10年、18年和27年,两者的波动周期基本吻合。将他们的IMF分量进行对比,发现能源消费和GDP二者是相互依赖的,这一结论符合经济学的理论,能源的需求促进经济的发展,而能源的发展要以经济增长为前提,能源的短缺将制约经济的发展。因此,千方百计增加能源供给,提高能源利用效率,是确保我国经济持续稳定发展的一项重要任务。
基于“税金增量最小化”的工资奖金纳税筹划
张旭丽
财会月刊 , 2010,
Abstract: 我国现行个人所得税制度中“工资、薪金”所得和年终一次性奖金的计税方法存在一定的差异,这就导致不同的工资、奖金组合对个人税后收益的影响不同。另外,全年一次性奖金特殊的计税方法可能导致“虽然增发了奖金但税后收益减少”这种有违常理的后果出现。基于“税金增量最小化”原则的个人工资、奖金组合方案可以规避“税收陷阱”并使整体税负最小化,从而保障纳税人的合法权益。【关键词】工资奖金收入增量税金增量2009年8月17日,国家税务总局发布《关于明确个人所得税若干政策执行问题的通知》(国税发[2009]121号),其明确规定《国家税务总局关于个人所得税若干政策问题的批复》(国税函[2002]629号)第一条有关“双薪制”的计税方法停止执行。但是这并不意味着增加了纳税人的负担,而只是对个税执行中的偏差做了明确规定。目前世界各国对个人所得税的征收模式不尽相同,我国现行个人所得税采取分类所得税制,并根据个人所得的不同性质和特点,综合运用比例税率和累进税率形式计税。其中,对个人所得税中的“工资、薪金”(简称“工资”)所得,采用超额累进税率计税。
Bioinformatics analysis of candidate sequences between two flanking markers linked with resistance gene Ht1 to Exserohilum turcicum in maize
玉米大斑病抗性基因Ht1定位区域内候选序列的生物信息学分析

E Yang,LIN Feng,ZHANG Chun-Yu,CUI Na,XU Yu-Feng,
鄂洋
,林凤,张春宇,崔娜,许玉凤

遗传 , 2009,
Abstract: In order to get Ht1 candidate sequence(s), bioinformatics method was employed to analyze sequences between two flanking markers umc22a and umc122a linked with Ht1. Sixty-three open reading frame (ORF) sequences were found, fourteen of which encoded protein domains. The amino acid sequences encoded by these ORF sequences were blasted with the 24 cloned resistance gene amino acid sequences, and a phylogenetic tree was constructed. Among the fourteen ORF sequences, gpm565a with nucleotide binding site (NBS), containing a lot of random coils, had both high identity and close relationship with Xal resistant to bacterial blight, and was predicted to be related with Ht1. The remaining thirteen ORF sequences had no enough evidence to show any relationships with Ht1 due to lack of conserved domains, low identity or distant relationships.
气质的遗传因素:基因多态性研究
张明浩1,陈欣银2,陆祖宏1
心里发展与教育 , 2010,
Abstract: 气质是婴儿出生以后最早表现出来的一种人格特征,而人格特征的形成具有一定的生物学基础。气质作为人格特征的组成单元,与人格特征享有共同的生物过程。因此,与成年人人格特征相关的基因也有可能影响儿童气质。本文在成年人的人格特征研究的基础上,针对早期儿童发展的特点,讨论了可能影响早期儿童气质的候选基因。研究成人的人格特征与基因的相关性不能排除环境因素的影响,本文强调了对早期儿童气质与基因多态性之间的关系进行直接研究的重要性。
基于邻域相关性的背景重构
肖梅,张雷,寇雯玉,刘伟,苗永禄
科技导报 , 2012, DOI: 10.3981/j.issn.1000-7857.2012.24.009
Abstract: 背景差法是一种重要的运动检测方法,当场景中背景被长时遮挡,并非总是以最大频率出现时,往往容易将前景错误地认为是背景,从而产生错误的重构,针对该问题本文提出了一种基于邻域相关性的背景重构算法.算法首先对输入数据进行排序;其次利用简单归类算法对排序后的数据进行分类;再次计算灰度类的出现频率,根据灰度类的出现频率得到像素的背景确定标识,并为背景不确定的像素选定候选背景;最后对背景不确定的像素循环执行背景确定程序,即基于像素邻域相关性,选择和邻域相似度最大的候选背景为像素的确定背景.为验证算法的有效性,对算法进行了多种场景的仿真实验,仿真实验表明,即使在背景被长时遮挡的环境中,算法仍能很好构建背景,从而有利于后续的运动目标检测、识别和跟踪.
奶牛乳房炎抗性候选基因的研究进展
张婧敏,陈宏,张春雷,杜毓,石秀英,房兴堂
生物技术通报 , 2010,
Abstract: 乳房炎是奶业生产中的一种常见病,发病率很高,每年给世界各国奶牛饲养者造成严重的经济损失。乳房炎的影响因素很多,但遗传因素对其起着重要作用。综述了乳铁蛋白基因、MHC/BoLA基因、ToLL样受体家族基因、趋化性细胞因子受体基因、牛锌指蛋白313基因、β-防御素基因和热休克蛋白70基因等奶牛乳房炎抗性候选基因的研究现状。
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