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Single nucleotide polymorphisms in chicken genomic pre-microRNA
鸡基因组pre-microRNA SNP多态性

Liying Geng,Chuansheng Zhang,Lixin Du,<br>,张传生,杜立新
生物多样性 , 2009,
Abstract: 为探讨鸡pre-microRNA SNP的多态性及其可能的功能意义, 对鸡471个pre-microRNA区域的SNP位点进行了鉴定和生物信息学分析。结果表明: pre-microRNA的SNP多态性显著地低于其侧翼区(P<0.01=, 其种子区SNP变异对pre-microRNA二级结构稳定性的影响高于其他各区; microRNA成熟体SNP可能影响microRNA对靶基因的选择。研究结果提示: pre-microRNA相对于其侧翼区在分子进化过程中受到更大的选择压力; 成熟体SNP可通过影响microRNA加工和靶基因的选择, 改变多种生理过程, 导致鸡种间表型变异。研究结果将为鸡microRNA的进化模式研究及其功能性SNP的鉴定提供参考信息。
Identification of SNPs located in putative microRNA tar-get region of six functional genes in chickens through bioinformatic analysis
鸡6个功能基因microRNA靶标区域SNP的生物信息学预测

Li-Ying Geng,Chuan-Sheng Zhang,Li-Xin DU,<br>,张传生,杜立新
遗传 , 2008,
Abstract: GDF-8, IGF-I, IGF-III, IGF2R, IGFBP2, and GHR are candidate genes affecting important economic trait in chicken. The putative microRNA target sites of 3' untranslated region of these genes were identified by means of specialized algorithms (miRanda and TargetScan), and the candidate SNPs located in the microRNA target region were also identified. Approximately 125 candidate SNPs were found throughout the 26 putative microRNA target regions in six gene 3'-UTR. Among the 125 SNPs, 47 were located in the microRNA targets, 44 and 35 were located in 5'and 3'flanking regions which equalled to the size of the given target. Twelve of the 47 candidates were located in the match of the microRNA seed. These SNPs, which were located in the match of the microRNA seed and 3 ' flanking regions may affect microRNA regulation and contribute to poultry phenotypic variation.
cens-2基因u3-r序列的克隆分析与表达载体的构建
张传生,,杜立新
牲畜兽医学报 , 2005,
Abstract: ?克隆并测序了1.2kb的鸡cens-2(chickennormastemcellgene-2,cens-2)基因3′端u3-r样结构调控序列。经序列分析和同源性比较表明,所克隆的u3-r序列包含多个转录因子结合位点如ap-1、gata-1等,同时还包括一个重要的顺式调控元件b区,该区域在鸡正常的胚胎干细胞中有特异的增强子活性。该序列经pmd-18t载体过渡后,定向连接于切去启动子的pegfp-n1载体的上游,构建了鸡cens-2基因u3-r样序列调控的绿色荧光蛋白基因报告载体,为下一步对鸡胚胎干细胞(ces)细胞标记研究打下基础。
鸡基因组pre-micrornasnp多态性
,张传生,*,杜立新
生物多样性 , 2009,
Abstract: ?为探讨鸡pre-micrornasnp的多态性及其可能的功能意义,对鸡471个pre-microrna区域的snp位点进行了鉴定和生物信息学分析。结果表明:pre-microrna的snp多态性显著地低于其侧翼区(p<0.01=,其种子区snp变异对pre-microrna二级结构稳定性的影响高于其他各区;microrna成熟体snp可能影响microrna对靶基因的选择。研究结果提示:pre-microrna相对于其侧翼区在分子进化过程中受到更大的选择压力;成熟体snp可通过影响microrna加工和靶基因的选择,改变多种生理过程,导致鸡种间表型变异。研究结果将为鸡microrna的进化模式研究及其功能性snp的鉴定提供参考信息。
冀鲁豫花生育成品种的遗传多样性分析
,,崔顺,陈焕,魏新燕
植物遗传资源学报 , 2012,
Abstract: 以冀、鲁、豫三省不同地域的41个花生育成品种为材料,利用SSR分子标记结合田间表型鉴定、聚类分析等方法对其遗传多样性进行了研究。结果表明,21对SSR引物对41个花生育成品种进行了扫描,共检测到52个等位变异,每个位点2~4个,平均2.5个,Shannon信息指数变幅为0.21~1.40,平均为0.73,聚类分析显示在阈值为5.54可将供试品种分为3大类群7个亚类。不同品种9个农艺性状变异系数在13.16%~186.49%之间,基于农艺性状的聚类分析结果显示在阈值为5.48时可以将供试品种分为6大类群11个亚类,各大类群间品种的农艺性状表现各具特点。
Rhododendron longesquamatum var. glabristylum (Ericaceae) a new variety from Sichuan, China
光柱长鳞杜鹃--四川杜鹃花属一新变种

GENG Yu-Ying,<br>
植物分类学报 , 2003,
Abstract: 描述了四川杜鹃花属一新变种-光柱长鳞杜鹃Rhododendron longesquamatum Schneid.var.glabristylum Y.Y.Geng et Z.L.Zhao.该变种与原变种长鳞杜鹃R.longesquamatum Schneid.var.longesquamatum的主要区别是叶片和花较小,叶片及叶脉成熟后无毛或仅见零星残存毛,花萼仅有绒毛而无腺毛,花柱光滑。
New Synonymies in the genus Rhododendron from China
中国杜鹃花属几个新异名

GENG Yu-Ying,<br>
中国科学院研究生院学报 , 2004,
Abstract: Five species and two varieties in the genus Rhododendron from Guangdong, Guangxi and Sichuan, namely R. chunienii Chun & Fang, R. dentampullum Tam, R. gonggashanense W. K. Hu, R. polyraphidoideum var. montanum Tam, R. subenerve Tam, R. subenerve var. nudistylum Tam, and R. viscigemmatum Tam, are reduced to synonymies. R. shimianense Fang & P. S. Liu is treated as a form of R. lutescens Franch., and thus a new combination, R. lutescens Franch. f. shimianense (Fang & P. S. Liu) Y. Y. Geng, is proposed.
Rhododendron longesquamatum var. glabristylum (Ericaceae), a new variety from Sichuan, China
光柱长鳞杜鹃——四川杜鹃花属一新变种

GENG Yu-Ying,<br>
中国科学院研究生院学报 , 2003,
Abstract: 描述了四川杜鹃花属一新变种——光柱长鳞杜鹃 Rhododendron longesquamatumSchneid. var. glabristylum Y. Y. Geng et Z. L. Zhao。该变种与原变种长鳞杜鹃R. longesquamatum Schneid. var. longesquamatum的主要区别是叶片和花较小,叶片及叶脉成熟后无毛或仅见零星残存毛,花萼仅有绒毛而无腺毛,花柱光滑。
应用PCR技术定向引入DNA小片段的策略
张传生,,孟春花,杨娜娜,朱靖,杜立新
生物技术通报 , 2005,
Abstract: 描述一种应用PCR技术定向引入DNA小片段和特异酶切位点的方法。为了获得m2/loxp66EGFPloxp71基因片段。根据EGFP基因序列,设计一对特异引物,上、下游引物分别引入m2/loxp66、loxp71序列和Xhol、Mlu1酶切位点。以pEGFPN1质粒为模板,采用PCR扩增以合成DNA双链,插入到克隆载体pMD18T。对重组子测序结果表明,实现了DNA小片段和酶切位点的定向引入。
4个绵羊品种线粒体细胞色素b基因的序列差异和系统进化研究
张传生,,万海伟,李吉涛,杜立新
牲畜兽医学报 , 2005,
Abstract: ?测定了小尾寒羊、大尾寒羊、洼地绵羊、滩羊和鲁北白山羊5个品种羊415bp线粒体dna细胞色素b基因片段,其中44个位点检出变异。分析其碱基组成和变异情况,并以鲁北白山羊为外群,用upgma和nj法构建了一系列分子系统树,得到相同的拓扑结构,在分子水平从母系遗传的角度澄清4个绵羊品种的起源分化关系。结果显示:在4个绵羊品种之间,洼地绵羊与滩羊关系最近与小尾寒羊亲缘关系最远。绵羊品种内的平均差异为0·85%,线粒体dna多态性相对贫乏,推测4个品种绵羊具有共同的母系祖先。
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