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Heran a e liga o em locos de isoenzimas em Genipa americana L. Inheritance and linkage in isozymes loci of Genipa americana L.
Alexandre Magno SEBBENN
Revista do Instituto Florestal , 2004,
Abstract: A heran a e a liga o foram estudadasem quatro locos polimórficos (6pghd-1, Pgi-2,Mdh-1 e Mdh-2) de três sistemas isoenzimáticos deGenipa americana, analisados por eletroforesehorizontal em gel de amido, usando tecidoscoletados de quinze progênies de poliniza o aberta,procedentes de Moji-Gua u, Estado de S o Paulo.Esses locos segregaram de dois a três alelos.A segrega o nesses locos foi homogênea entreárvores. Contudo, existem desvios significativos dasegrega o esperada 1:1 para algumas árvores emalguns locos. Desvios significativos da raz o desegrega o esperada 1:1 foram detectados noslocos Mdh-2 e 6pgdh-1. N o foram detectadasevidências de liga o entre nenhum dos pares delocos avaliados em G. americana e esses podemser utilizados sem restri o para estudos do sistemade reprodu o, diversidade e estrutura genética depopula es da espécie.Inheritance and linkage for fourpolymorphic loci (6pghd-1, Pgi-2, Mdh-1 andMdh-2) from three enzyme systems in Genipaamericana were analyzed by horizontal starch gelelectrophoresis using tissues collected from fiftyopen-pollinated families in Moji-Gua u, S o PauloState. These allozyme loci have segregated fromtwo to four alleles per polymorphic locus. Genesegregation on those loci was homogeneous amongtrees. However, there were significant deviationsfrom the expected segregation ratios on some lociand some individual trees. In addition, Mdh-2 and6pgdh-1 loci have shown significant deviationsfrom the 1:1 expected segregation ratio. Linkagedisequilibrium evidences were not detected betweenany two pairs of loci from G. americana and thosecan be used with no restriction to study the matingsystem, genetic diversity, and genetic structure onthe species.
Heran a e desequilíbrio de liga o em locos isoenzimáticos de Eschweilera ovata. Inheritance and linkage disequilibrium in allozymes loci of Eschweilera ovata.
Eduardo GUSSON,Alexandre Magno SEBBENN
Revista do Instituto Florestal , 2004,
Abstract: A heran a e o desequilíbrio de liga oentre 11 locos polimórficos de oito sistemasisoenzimáticos foram estudados em progênies depoliniza o aberta de duas popula es deEschweilera ovata (Bambess.) Miers (biriba) doEstado da Bahia. A análise da segrega o deprogênies de árvores heterozigotas revelou simplesheran a mendeliana para onze locos (Acp-1, Dia-1,Dia-2, Dia-3, G6pdh-1, Mdh-1, Nadh-1, Nadh-2,Pgi-1, Pgi-2 e 6pgdh-1). A segrega o desseslocos foi geralmente homogênea entre árvores,embora algumas tenham apresentado desviossignificativos da segrega o esperada 1:1.Desvios significativos do equilíbrio gaméticoforam detectados entre três pares de locos:6pgdh-1:Pgi-2, Dia-1:Dia-2 e Dia-2:Dia-3.Inheritance and gametic disequilibriumwere studied between 11 polymorphic loci of theeight isozymes systems from open-pollinatedfamilies of two Eschweilera ovata (Bambess.)Miers (biriba) populations from Bahia State.Segregation analysis of families from heterozygotetrees revealed simple mendelian inheritance foreleven loci (Acp-1, Dia-1, Dia-2, Dia-3, G6pdh-1,Mdh-1, Nadh-1, Nadh-2, Pgi-1, Pgi-2 and 6pgdh-1).Gene segregation at these loci was generallyhomogeneous among trees. However, there weresignificant deviations from the expectedsegregations ratio 1:1 at some individual trees.Significant gametic disequilibrium was observedfor three pairs of loci: 6pgdh-1:Pgi-2, Dia-1:Dia-2and Dia-2:Dia-3.
Estimativa de tamanho efetivo de endogamia por marcadores genéticos
Sebbenn, Alexandre Magno;Seoane, Carlos Eduardo Sicole;
Revista árvore , 2005, DOI: 10.1590/S0100-67622005000100001
Abstract: conservation and genetic improvement activities require measures of effective size in order to maintain and control the evolutive potential of the populations under manipulation. natural populations are sometimes structured and thus levels of endogamy and relatedness can exist. the aim of this work is to describe an estimator for the inbreeding effective population size of monoecious species populations with any level of endogamy and relatedness. the estimator was derived assuming that endogamy is the same in all individuals of the population. this can be used in populations with known pedigree or the average of the relatedness between pairwise individuals of target populations can be estimated by codominant genetic markers. an example is given in which the estimator is applied to a natural population of a monoecious tree species, euterpe edulis.
Heran a e desequilíbrio de liga o em locos de isoenzimas de Trema micrantha. Inheritance and linkage disequilibrium in isozymes loci of Trema micrantha.
Luciano Arruda RIBAS,Alexandre Magno SEBBENN
Revista do Instituto Florestal , 2004,
Abstract: Nove sistemas enzimáticos (ACP, DIA, EST, GDH, GOT, G6PDH, IDH, MDH e SKDH) codificando doze locos polimórficos (Acp-1, Acp-2, Acp-3, Dia-1, Est-1, Gdh-2, Got-1, G6pdh-1, Idh-1, Mdh-1, Mdh-3 e Skdh-1) foram investigados em Trema micrantha. A heran a mendeliana de progênies de árvores heterozigotas foi confirmada para todos os locos, pelo teste de ajuste dos padr es de segrega o observados em rela o à raz o de segrega o esperada 1:1. O desequilíbrio de liga o foi examinado para 55 pares de locos. Foram detectados desequilíbrios de liga o significativos em cinco pares de locos: Acp-1:Acp-3, Acp-1:Idh-1, Dia-1:Mdh-1, Dia-2:Got-1 e Gdh-2:Got-1.Nine enzymes systems (ACP, DIA, EST, GDH, GOT, G6PDH, IDH, MDH and SKDH) coding for twelve polymorphic loci (Acp-1, Acp-2, Acp-3, Dia-1, Est-1, Gdh-2, Got-1, G6pdh-1, Idh-1, Mdh-1, Mdh-3 and Skdh-1) were investigated in Trema micrantha. Mendelian inheritance was confirmed for all loci by testing the fit of band-pattern segregation in progeny from heterozygous trees to expected 1:1 ratio. Linkage disequilibrium was examined for 55 pair of allozymes loci. Five pairs of loci appear to be in linkage disequilibrium: Acp-1:Acp-3, Acp-1:Idh-1, Dia-1:Mdh-1, Dia-2:Got-1 and Gdh-2:Got-1.
Parametros genéticos e ganhos na sele o para produ o de resina em Pinus elliottii var. elliottii, no sul do Estado de S o Paulo. Genetic parameters and selection gains for oleoresin production in Pinus elliottii var. elliottii, in south of S o Paulo State.
Reinaldo Cardinali ROMANELLI,Alexandre Magno SEBBENN
Revista do Instituto Florestal , 2004,
Abstract: Os objetivos deste trabalho foram estimar parametros genéticos e ganhos na sele o para produ o de resina, em Pinus elliottii Engelm. var. elliottii, aos 4 e 12 anos de idade, respectivamente, em três locais do sul do Estado de S o Paulo. Progênies de poliniza o aberta de 90 árvores fenotipicamente superiores de P. elliottii var. elliottii, selecionadas para produ o de resina, em popula o comercial, em Itapetininga, SP, foram ensaiadas na Floresta Estadual de Angatuba e Esta es Experimentais de Itapetininga e Itapeva, empregando-se 90 tratamentos (progênies), três repeti es, 10 árvores por parcela e uma testemunha comercial de P. elliottii var. elliottii e outra de P. caribaea Mor. var. bahamensis Bar. et Gol. Foram detectadas diferen as genéticas significativas entre progênies para produ o de resina em Itapetininga, Itapeva e na análise conjunta para locais, indicando a possibilidade de ganhos na sele o. A intera o genótipo x ambiente para produ o de resina aos 12 anos de idade foi significativa (α = 0,05) e do tipo complexa, sugerindo que a melhor estratégia de sele o é a de multipopula es. A produ o de resina, aos 12 anos de idade, nas progênies de P. elliottii var. elliottii, superaram as testemunhas comerciais. O coeficiente de varia o genética e as herdabilidades mostraram a possibilidade de ganhos moderados com a sele o para a produ o de resina. A correla o genética entre DAP e produ o de resina foi baixa, mas positiva. As correla es genéticas entre as idades de 4 e 12 anos foram altas (g ≥ 0,55) mostrando a possibilidade de sele o em idades precoces. Os ganhos esperados na sele o para produ o de resina variaram de baixos (1,6%) a altos (29,2%) entre locais.The aims of this work were to estimate the genetic parameters and selection gains of oleoresin production in Pinus elliottii var. elliottii, at 4 and 12 years old, respectively, on three sites of the south of S o Paulo State, Brazil. Open-pollinated families of 90 P. elliottii var. elliottii trees were selected to oleoresin production, on commercial stands, in Itapetininga, SP. The experiments were assayed in Angatuba State Forest, Itapetininga and Itapeva Experimental Stations using three blocks, 10 plants per plot, and a commercial control of P. elliottii var. elliottii and P. caribaea var. bahamensis. Significant differences among families to oleoresin production were detected in both Experimental Stations and joint analysis, indicating the possibility of genetic gains through selection. The site x genotype interactions were significant to oleoresin production at 12 ye
Heran a e desequilíbrio de liga o em sete locos isoenzimáticos de Cecropia pachystachya. Inheritance and linkage disequilibrium in sevem isozymes loci of Cecropia pachystachya.
Luciano Arruda RIBAS,Alexandre Magno SEBBENN
Revista do Instituto Florestal , 2004,
Abstract: Seis sistemas enzimáticos (ACP,G6PDH, IDH, PGI, PGM e SKDH), codificandosete locos polimórficos (Acp-3, G6pdh-1, Idh-1,Pgi-2, Pgm-1, Pgm-2 e Skdh-1), foram investigadospara a heran a e desequilíbrio de liga o emCecropia pachystachya Trec. A heran a mendelianafoi confirmada para todos os locos avaliados.Desvios significativos da raz o de segrega oesperada 1:1 foram detectados apenas em umaprogênies de árvore heterozigótica. O desequilíbriode liga o foi examinado para 21 pares de locosisoenzimáticos, n o sendo detectados desequilíbriosentre nenhum deles e, assim, estes podem serutilizados em subseqüentes estudos do sistemade reprodu o, diversidade e estrutura genética deC. pachystachya.
Sistema de reprodu??o em popula??es de Eschweilera ovata (Cambess.) Miers
Gusson, Eduardo;Sebbenn, Alexandre Magno;Kageyama, Paulo Yoshio;
Revista árvore , 2006, DOI: 10.1590/S0100-67622006000400001
Abstract: the mating system of two populations of eschweilera ovata was studied by allozymes analysis of progeny arrays using the mixed-mating model and correlated mating model. deviations from mixed-mating model were evident from differences in pollen and ovule allele frequencies and allele frequency heterogeneity of pollen pools that fertilized the different trees. the multilocus outcrossing rate was high in both camarugipe (tm=0.999±0.004) and itaparica populations (tm=0.985±0.023). the high variation in individual outcrossing rate (t ranged from 0.320 to 1.000) indicated that the species is not self-incompatible. positive differences and significantly different from zero between multilocus and single locus outcrossing rate were detected, indicating biparental inbreeding in both camarugipe (tm - ts=0.066±0.014) and itaparica populations (tm - ts=0.073±0.016) and possible spatial genetic structuring. higher values of correlated mating were detected in the populations (camarugipe, rp=0.577±0.088; itaparica rp=0.423±0.070), showing that the families consisted mainly of half-sib and full-sib mixtures. the coancestry coefficient within families from both populations (camarugipe, qxy=0.211; itaparica qxy=0.191) was higher than the expected in half-sib families (0.125). the results were discussed from the point of view of sampling for improvement, genetic conservation and seed collection aiming at environmental recovery.
Heran a e liga o em isoenzimas de Tabebuia cassinoides. Inheritance and linkage of isozymes of Tabebuia cassinoides.
Alexandre Magno SEBBENN,Carlos Eduardo Sícoli SEOANE
Revista do Instituto Florestal , 2004,
Abstract: A heran a e a liga o foram estudadasem oito sistemas isoenzimáticos revelados em21 progênies de poliniza o aberta de Tabebuiacassinoides (Lam.) D.C. (caixeta) amostradas empopula es do Estado de S o Paulo. Doze zonasenzimáticas foram consistentemente identificadas,sendo todas polimórficas. A segrega o dos locosfoi homogênea entre as árvores e n o foramdetectados fortes indícios de desvio de segrega omendeliana. O loco 6pgdh-1 apresentou desviossignificativos da raz o de segrega o esperada 1:1,mas o tamanho amostral utilizado indica anecessidade de reavalia o desse padr o, usandomaior número de árvores heterozigotas. Evidênciasde liga o foram detectadas entre três pares delocos: Pgi-2:Idh-1, Pgm-1:Per-1 e Per-2:Est-1.Inheritance and linkage were studied ineight isoenzymes from 21 open-pollinated familiesof Tabebuia cassinoides (Lam.) D.C. (caixeta),sampled in populations from S o Paulo State.Twelve enzyme zones were consistently identified.In all loci, the segregation ratio was homogeneousamong heterozygous trees and evidences ofdeparture from expected mendelian segregationwere not detected. 6pgdh-1 locus showedsignificant deviation from the expected 1:1segregation ratio, but it is necessary to enlarge thesample size to better the evaluation. Linkageevidences were detected in three pairs of loci:Pgi-2:Idh-1, Pgm-1:Per-1 and Per-2:Est-1.Key words: inheritance; isozymes; Tabebuiacassinoides; tropical tree species.
Heran a e desequilíbrio de liga o em nove locos isoenzimáticos de Eremanthus erythropappus. Genetic inheritance and linkage desequilibrium in nine isozyme loci of Eremanthus erythropappus.
Sybelle BARREIRA,Alexandre Magno SEBBENN,Paulo Yoshio KAGEYAMA
Revista do Instituto Florestal , 2005,
Abstract: A heran a e o equilíbrio genotípicoforam estudados em sete sistemas isoenzimáticos(ACP, EST, 6PGDH, PGM, PGI, DIA e G6PDH),codificando sete locos em Eremanthus erythropappus.A análise foi baseada na segrega o de progênies depoliniza o aberta de árvores maternas heterozigotase o desequilíbrio foi estudado com base na medida dedesequilíbrio genotípico de Burrows. O locoG6pdh n o p de ter sua heran a estudada porquen o foram detectadas árvores maternas heterozigóticaspara este loco. As outras seis enzimas erampolimórficas e foram encontradas árvores maternasheterozigóticas. A heran a mendeliana de seislocos (Acp, Est, 6pgdh, Pgi, Pgm e Dia) foiconfirmada pelo ajuste das freqüências gaméticasmaternas observadas às esperadas pelo modelo desegrega o 1:1. O desequilíbrio de liga o foiexaminado para 21 pares de combina es de locos.Um único par de locos parece estar emdesequilíbrio de liga o, Dia/G6pdh.The inheritance and linkagedisequilibrium were studied in seven enzymesystems (ACP, EST, 6PGDH, PGM, PGI, DIA eG6PDH), codifying for seven loci in Eremanthuserythropappus. The segregation analysis was basedon the segregation of open-pollinated offspringsfrom heterozygous mother-trees and the linkagedisequilibrium was studied using Burrowsgenotypic disequilibrium measure. The inheritanceof G6pdh locus was not studied because noheterozygous mother-tree was detected. Anothersix enzymes were polymorphic and heterozygousmother-tree could be found. Mendelian inheritancewas confirmed for all six loci by the fitting of theobserved maternal gametic frequencies to thoseexpected from the 1:1 segregation ratio model.Linkage disequilibrium was examined for as manyas 21 pairs of allozyme loci. A single pair of lociappears to be in gametic disequilibrium,Dia/G6pdh.
Heran a genética e desequilíbrio de liga o em locos de isoenzimas em Esenbeckia leiocarpa. Genetic inheritance and linkage disequilibrium in isozymes loci of Esenbeckia leiocarpa.
Carlos Eduardo Sícole SEOANE,Alexandre Magno SEBBENN
Revista do Instituto Florestal , 2004,
Abstract: Oito sistemas enzimáticos (EST, IDH, PGM, PGI, MDH, PER, 6PGDH e SKDH) codificando nove locos foram investigados em Esenbeckia leiocarpa. Quatro sistemas isoenzimáticos foram monomórficos (IDH, PGM, 6PGDH e SKDH) e quatro polimórficos (EST, PGI, MDH e PER). A heran a mendeliana foi confirmada para quatro locos, pelo teste de ajuste dos padr es de segrega o observados em rela o à raz o de segrega o esperada 1:1, em progênies de árvores heterozigotas. O desequilíbrio de liga o foi examinado para dez pares de locos. Apenas um simples par de locos parece estar em desequilíbrio de liga o, Est-1:Prx-1.Eight enzymes systems (EST, IDH, PGM, PGI, MDH, PER, 6PGDH and SKDH) coding for nine loci were investigate in Esenbeckia leiocarpa. Four allozyme systems were monomorphic (IDH, PGM, 6PGDH and SKDH) and four polymorphic (EST, PGI, MDH and PER). Mendelian inheritance was confirmed for four loci by testing the fit of band-pattern to 1:1 expected segregation ratio in progeny from heterozygous trees. Linkage disequilibrium was examined for ten pair of allozymes loci. A simple pair of loci appears to be in linkage disequilibrium, Est-1:Prx-1.
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