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基于序列关联的蛋白质亚细胞定位识别
Recognition of Subcellular Localization of Proteins Using of Sequences Fusion
 [PDF]


Hans Journal of Computational Biology (HJCB) , 2011, DOI: 10.12677/hjcb.2011.11001
Abstract: 对未知蛋白的功能注释是蛋白质组学的主要目标。一个关键的注释是蛋白质亚细胞定位的预测。应用基于序列关联的二次判别分析方法进行蛋白质亚细胞定位预测,对4个植物定位类型进行5-fold交叉检验。
Functional annotation of unknown proteins is a major goal in proteomics. A key annotation is the prediction of a protein’s subcellular localization. We used the method of Increment of Diversity with Quad-ratic Discriminant analysis (IDQD) to predict subcellular localization of proteins which are recognized by the four plant categories and three non-plant and obtained accuracy 87.4(±0.5)% and 91.2(±0.2)%, respectively in 5-fold cross-validation test. Our result is better than comparable existing methods.
椭圆曲线上的链式验证签名
丁义,
北京邮电大学学报 , 2009, DOI: 10.13190/jbupt.200903.42.150
Abstract: 基于椭圆曲线密码算法,提出了一种新的链式验证签名方案,只有经过链式验证授权组中的成员P1、P2、...、Pn-1的一一授权之后,签名验证者Pn才能验证签名的有效性。分析了所给签名方案的安全性和效率。除了具有链式验证签名的一般特性外,还可以方便地增加或删除链式验证授权者,并在链式验证授权者或签名验证者泄漏子秘密时,可以及时地进行维护。
基于粒子群优化rbf神经网络的水轮发电机组振动故障诊断
嵘?,陈晓,李 辉?
西北农林科技大学学报(自然科学版) , 2009,
Abstract: [目的]针对单一径向基(rbf)神经网络在水轮发电机组振动故障诊断中泛化能力不足的缺点,提出基于粒子群(pso)算法优化的rbf神经网络.[方法]利用pso算法操作简单、容易实现等特点及其深刻的智能背景,对rbf神经网络的参数(中心和宽度)、连接权重进行优化,并用经pso算法优化的rbf神经网络对水轮发电机组振动故障进行仿真诊断.[结果]仿真诊断结果表明,pso算法优化的rbf神经网络具有较好的分类效果,较rbf诊断模型精度高、收敛快.[结论]pso算法优化的rbf神经网络,适用于水轮发电机组振动故障诊断,其诊断精度较高,具有推广应用价值.
酵母核小体中心序列局域偏好和连接序列的多样性
The local preference of nucleosome core sequences and the diversity of linker sequences in yeast

郑燕,李宏,,孟虎
- , 2017, DOI: 1672-4291(2017)03-0073-07doi:10.15983/j.cnki.jsnu.2017.03.335
Abstract: 基于酵母单碱基精度的核小体位置数据,提取核小体中心及连接序列分析两类序列的精细结构和模体偏好。结果显示,区分两类序列最主要的是稀有模体(GCG、CGC、CGG和CCG),其次是富含模体(AAA和TTT)。将核小体中心序列等分为3个单元,发现中单元与核小体中心序列相对偏差的分布相似,两翼单元分布部分类似于连接序列,表明中单元的核小体定位信号强而两翼具有连接序列的部分序列特征。通过分析11个核小体连接序列长度组的G+C含量发现其长度与G+C含量成负相关,而MEME模体搜索结果显示11个长度组主要有4类保守模体,意味着连接序列的多样性
The Recognition of σ70 Promoters in Escherichia coli K-12
大肠杆菌σ70启动子的识别

ZHANG Ying,JIA Yun,
张颖
,,吕军

生物物理学报 , 2007,
Abstract: 应用多样性增量结合二次判别分析(Increment of Diversity with Quadratic Discriminant analysis,IDQD)方法,对大肠杆菌σ^70启动子进行识别。使用受试者操作特性(receiver operating characteristic,ROC)曲线和精度召回率曲线(Precision Recall Curves,PRC)进行性能评估。10-fold交叉检验给出,在正负集之比为1:1时,ROC曲线下面积和PRC曲线下面积均为95%。结果表明,IDQD算法有能力应用于原核启动子的识别。识别精度高于现有算法。
甘南亚高山草甸围封地群落演替及植物光合生理特征
陈世伟, 刘旻霞, , 安琪, 安嫣菲
植物生态学报 植物生态学报 , 2015, DOI: 10.17521/cjpe.2015.0033
Abstract: ?为了解甘南亚高山草甸围封地恢复演替动态,探究围封恢复进程中植物光合生理特征的变化规律及其影响因子,对围封试验地内5个典型群落样地进行样方调查,测定了各群落优势种及3个共有种的光合参数和叶性状参数,并测定了群落表层土壤(0–20cm)的水分含量及全氮含量。结果显示:该围封地内形成一个以草本植物→半灌木→灌木的演替序列,群落表层土壤含水量及全氮含量随着演替的进行逐渐增加;在演替的时间尺度上,各演替阶段优势种光合生理特征间存在明显差异,随着演替的进行,群落优势种的净光合速率(Aarea)、光合水分利用效率(WUE)、相对叶绿素含量(SPAD)呈降低趋势,其叶片氮含量(Nmass)、光合氮利用效率(PNUE)、比叶面积(SLA)随演替变化没有严格一致的规律,而更多地表现为不同植物功能型之间的差异;从演替前期到后期,同种植物的Aarea、SPAD值逐渐降低,非豆科植物披碱草(Elymusdahuricus)、老鹳草(Geraniumwilfordii)的PNUE、WUE随演替进行呈降低趋势,其Nmass、SLA随演替进行却呈增加趋势,然而豆科植物紫苜蓿(Medicagosativa)由于具有固氮能力,受养分限制不明显,这些光合生理特征值没有随演替发生明显的变化。这些结果表明,在恢复演替过程中,该围封地由一个物质获得能力强的群落向物质保持能力强的群落过渡,土壤水分含量及全氮含量是推动这种过渡发生的主要因子。掌握围封地群落演替过程中的光合生理动态对于亚高寒退化草甸恢复具有一定的理论指导意义。
宽叶缬草对高胆固醇血症大鼠肾组织内TGF-β1表达的影响
司晓,汝汉,黄从新,丁国华,刘红燕
中国中药杂志 , 2003,
Abstract: 目的:探讨宽叶缬草对高胆固醇血症大鼠肾组织内转化生长因子β1(TGF-β1)表达的影响及其意义。方法:用含4%胆固醇和1%胆酸钠的高脂饲料饲喂大鼠建立高脂模型,观察宽叶缬草对大鼠血脂、尿蛋白和肾功能的影响,以及对肾小球细胞外基质增生、TGF-β1和Ⅳ型胶原表达的影响。结果:宽叶缬草有降低总胆固醇、低密度脂蛋白、尿蛋白和血肌酐的作用,肾病理和免疫组化证实宽叶缬草在降脂同时,能减轻肾小球系膜病变和细胞外基质产生,降低肾组织内TGF-β1和Ⅳ型胶原表达。结论:宽叶缬草对高脂血症肾脏有保护作用,此作用可能与其降低肾组织内TGF-β1表达有关。
中药七情合和理论的发展沿革
赵怀舟,,赵尚华,王红梅,张恒,王小
中国中药杂志 , 2005,
Abstract: 同中医学其他部分的理论知识类似,中药七情合和理论的形成与发展同样具备2个特点:其一,形成源远流长;其二,发展众手裁成。这两个特点为今天讨论其发展沿革带来许多不确定的因素,尽管较为困难,但是通过对相关文献的追溯与复习,初步给这个过程勾勒出一个发展梗概还是可能的。1中药七情理论的形成1·1《神农本草经》的最早论述大约成书于秦汉时期的《神农本草经》一书,较早就中药配伍应用的临床实践,进行了相应的归纳描述和初步的
添加纳米载银无机抗菌剂的室温固化PMMA材料体外抗菌效果评价
春丽|王晓容|张赐童|孙世群|杨
吉林大学学报(医学版) , 2012,
Abstract: 目的:研究添加纳米载银无机抗菌剂的室温固化聚甲基丙烯酸甲酯(PMMA)材料在体外对变形链球菌和白色念珠菌的抗菌效果,并检测纳米载银无机抗菌剂对室温固化PMMA材料机械性能的影响。方法:采用球磨法将纳米载银无机抗菌剂按0%、0.5%、1.0%、1.5%、2.0%、2.5%和3.0%添加到室温固化PMMA材料中,并制成抗菌试件,应用贴膜法测定这些抗菌试件在体外对变形链球菌和白色念珠菌的抗菌率。并在电子万能材料试验机、冲击试验机和摩擦磨损试验机上对这7种添加比例的抗菌试件进行弯曲强度、冲击强度和磨损性能的测试。结果:抗菌剂含量为1.0%时,对变形链球菌和白色念珠菌的抗菌率均达到50%以上;抗菌剂的含量为2.5%时,对变形链球菌和白色念珠菌的抗菌率均达到90%以上。抗菌剂含量在1.0%~1.5%范围内3种机械性能较对照组均有所提高,随着抗菌剂含量的增加,3种机械性能逐渐降低。当抗菌剂含量超过2.0%时,磨损性能与对照组比较差异有统计学意义(P<0.05);当抗菌剂含量超过2.5%时,弯曲强度和冲击强度与对照组比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论:添加纳米载银无机抗菌剂的室温固化PMMA材料显示了良好的抗菌效果,随抗菌剂含量增加,抗菌率逐渐提高。抗菌剂含量为2.0%时,既可以达到临床对抗菌的要求,又不会对室温固化PMMA材料的机械性能产生显著的影响。
棉铃虫在不同寄主作物上的种群分布
石庆宁,刘文旭,邵泽,海民
华北农学报 , 1995, DOI: 10.3321/j.issn:1000-7091.1995.z1.027
Abstract: 1991~1994年,在冀市粮棉混作区,采用田间调查的方法,研究棉铃虫在不同作物上的种群分布。结果表明:一代卵麦田占99.6%,二代卵棉田占84.9%;三代卵棉田占47.6%,玉米田占44.9%,大豆、花生、谷、甘薯田等占7.5%;四代卵棉田占53.6%,玉米田占34.6%,大豆、花生、谷、甘薯田等占11.8%。棉铃虫幼虫在不同作物上分布与卵分布比率有所不同,玉米田幼虫分布比率明显减少。人为防治影响幼虫分布,防治后棉田分布比率下降。
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