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Effet inhibiteur in vitro et in vivo du Trichoderma harzianum sur Fusarium oxysporum f. sp. Radicis-lycopersici
Hibar K.,,Daami-Remadi M.,Khiareddine H.,El Mahjoub M.
Biotechnologie, Agronomie, Société et Environnement , 2005,
Abstract: In vitro and in vivo antagonistic effect of Trichoderma harzianum against Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici. Tests of direct confrontation, on PDA medium or remote confrontation, between Fusarium oxysporum f. sp. radicislycopersici and Trichoderma harzianum, revealed that the latest has inhibited mycelial growth of the pathogen by more than 65% compared to the control and this after an incubation period of about four days at 25°C. Moreover, beyond this period and after six days, T. harzianum invades and also sporulates on F. oxysporum f. sp. radicis-lycopersici colonies revealing its high myco-parasitism. Some interesting results have also been obtained in vivo: indeed, transplantation of tomato seedlings in a mixture of perlite inoculated by F. oxysporum f. sp. radicis-lycopersici and T. harzianum reduced Fusarium crown and root rot incidence compared to seedlings planted in perlite only inoculated by the pathogen. Even better, seedlings planted in perlite containing the pathogen and the studied antagonist present a better vegetative growth and a vigorous root system compared to those of the healthy control (not inoculated and untreated).
Diagnostic et anomalies biologiques chez un drepanocytaire
E Mvoa Essono, T Nkoa
Clinics in Mother and Child Health , 2004,
Abstract: La drépanocytose est une hémoglobinopathie grave, fréquemment rencontrée dans la race noire et qui se manifeste par une anémie hémolytique chronique. Son diagnostic chez l'adulte peut se faire au moyen de plusieurs tests simples ; mais la méthode diagnostique utilisant les techniques d'électrophorèse d'hémoglobine est la plus communément utilisée. Elle réalise le diagnostic positif et donne des résultats fiables. D'autres techniques plus précises telle l' isoélectrofocalisation sur gel d'acrylamide sont déjà mises au point mais ne sont pas encore d' utilisation courante dans les pays en développement. Dans la période néonatale, le diagnostic de la drépanocytose pose des problèmes d' interprétation avec la technique d'électrophorèse conventionnelle, du fait de la proportion élevée de l'hémoglobine foetale à cet age. Il est possible de faire un diagnostic anténatal de la tare drépanocytaire. Celui-ci peut être effectué à partir de la 18è semaine d'aménorrhée ; ou même dès la 8è semaine. Il permet alors de réduire éventuellement la proportion relative des individus homozygotes mais exige une haute compétence en techniques obstétricales et en biologie moléculaire. La maladie drépanocytaire entra ne des anomalies biologiques d'une grande hétérogénéité, caractéristique de cette affection héréditaire. Mots cles: drépanocytose, diagnostic, anomalies biologiques Clinics in Mother and Child Health Vol. 1(1) 2004: 12-20
Effet des extraits de compost sur la croissance mycélienne et l'agressivité du Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici  [PDF]
Hibar K.,Daami-Remadi M.,Jabnoun-Khiareddine H.,El Akram Zna?di I.
Biotechnologie, Agronomie, Société et Environnement , 2006,
Abstract: Effect of compost tea on mycelial growth and disease severity of Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici. Simultaneous addition, on culture media, of Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici and compost teas revealed that the latest induced the inhibition of the mycelial growth of the pathogen. This inhibition, noted after an incubation period of about six days at 25°C, was more important when compost teas were enriched in PDB (Potato Dextrose Broth), where it may reach 70% compared to the control. Transplantation of tomato seedlings, previously inoculated by a conidial suspension of F. oxysporum f. sp. radicis-lycopersici, in a container media (peat, perlite or the mixture of the two substrates) treated by compost teas has signifi cantly reduced Fusarium crown and root rot incidence compared to inoculated and untreated control seedlings. Disease incidence is more reduced when tomato inoculated plants are transplanted in peat treated by compost teas; indeed, these plants don t show any wilting and present a vigorous root system and a better vegetative growth.
Traits biologiques et écologiques, intérêt et perspectives pour la bio-indication des pollutions toxiques  [PDF]
Virginie Archaimbault, Juliette Rosebery et Soizic Morin
Sciences Eaux & Territoires : la Revue du IRSTEA , 2010,
Abstract: La dégradation continue des écosystèmes aquatiques a intensifié le besoin de développer des méthodes d’évaluation de la qualité du milieu toujours plus performantes et pertinentes, basées sur la biologie et l’écologie des organismes. Dans ce contexte, l’utilisation des traits biologiques et écologiques en bio-indication fournit de nombreuses perspectives. Nous vous proposons, à travers l’exemple des diatomées et des macro-invertébrés, de voir comment sont déclinés ces traits bioécologiques en termes de bio-indication toxique.
Treillis de concepts et ontologies pour l'interrogation d'un annuaire de sources de données biologiques (BioRegistry)  [PDF]
Nizar Messai,Marie-Dominique Devignes,Malika Sma?l-Tabbone,Amedeo Napoli
Computer Science , 2005,
Abstract: Bioinformatic data sources available on the web are multiple and heterogenous. The lack of documentation and the difficulty of interaction with these data sources require users competence in both informatics and biological fields for an optimal use of sources contents that remain rather under exploited. In this paper we present an approach based on formal concept analysis to classify and search relevant bioinformatic data sources for a given query. It consists in building the concept lattice from the binary relation between bioinformatic data sources and their associated metadata. The concept built from a given query is then merged into the concept lattice. The result is given by the extraction of the set of sources belonging to the extents of the query concept subsumers in the resulting concept lattice. The sources ranking is given by the concept specificity order in the concept lattice. An improvement of the approach consists in automatic query refinement thanks to domain ontologies. Two forms of refinement are possible by generalisation and by specialisation. ----- Les sources de donn\'{e}es biologiques disponibles sur le web sont multiples et h\'{e}t\'{e}rog\`{e}nes. L'utilisation optimale de ces ressources n\'{e}cessite aujourd'hui de la part des utilisateurs des comp\'{e}tences \`{a} la fois en informatique et en biologie, du fait du manque de documentation et des difficult\'{e}s d'interaction avec les sources de donn\'{e}es. De fait, les contenus de ces ressources restent souvent sous-exploit\'{e}s. Nous pr\'{e}sentons ici une approche bas\'{e}e sur l'analyse de concepts formels, pour organiser et rechercher des sources de donn\'{e}es biologiques pertinentes pour une requ\^{e}te donn\'{e}e. Le travail consiste \`{a} construire un treillis de concepts \`{a} partir des m\'{e}ta-donn\'{e}es associ\'{e}es aux sources. Le concept construit \`{a} partir d'une requ\^{e}te donn\'{e}e est alors int\'{e}gr\'{e} au treillis. La r\'{e}ponse \`{a} la requ\^{e}te est ensuite fournie par l'extraction des sources de donn\'{e}es appartenant aux extensions des concepts subsumant le concept requ\^{e}te dans le treillis. Les sources ainsi retourn\'{e}es peuvent \^{e}tre tri\'{e}es selon l'ordre de sp\'{e}cificit\'{e} des concepts dans le treillis. Une proc\'{e}dure de raffinement de requ\^{e}te, bas\'{e}e sur des ontologies du domaine, permet d'am\'{e}liorer le rappel par g\'{e}n\'{e}ralisation ou par sp\'{e}cialisation
Temperature Effect on Mycelial Growth and on Disease Incidence of Fusarium oxysporum f.sp. radicis-lycopersici  [PDF]
Khaled Hibar,Mejda Daami-Remadi,Hayfa Jabnoun-Khiareddine,Mohamed El Mahjoub
Plant Pathology Journal , 2006,
Abstract: Fusarium crown and root rot of tomato (Lycopersicon esculentum) caused by Fusarium oxysporum f.sp. radicis-lycopersici is a new damaging disease of greenhouse crops in Tunisia. This pathogen was detected in Southern Tunisia, where temperature is usually high. Thus, temperature effect on its development was studied in vitro, on mycelial growth and in vivo, on disease incidence. Temperature effect on mycelial growth of Fusarium oxysporum. sp. radicis-lycopersici, evaluated on Potato Dextrose Agar (PDA) media, revealed that this pathogen grows well at temperatures ranged from 20 to 30°C. However, the optimum of mycelial growth was recorded at 25°C (growth speed exceeded 13 mm D-1). On disease incidence, temperature effect was evaluated by breeding inoculated plants under two thermal conditions: 19 and 29°C. Damages observed, after an incubation period ranged between 30 and 50 days, were more important at 19°C than that at 29°C. Indeed, at 19°C, disease incidence exceeded 96% and it was always more than 70%. At 29°C, however, this value didn`t exceed 60% and this by using two inoculation methods.
Influence of DNA treatments on Southern blot hybridization analysis of Fusarium oxysporum F. sp lycopersici and F. sp radicis-lycopersici genomic DNAs
OS Balogun
African Journal of Biotechnology , 2008,
Abstract: DNA samples obtained by a non-phenol/chloroform isolation method, from three races of Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici and f. sp. radicis-lycopersici were treated in different ways with a view to evaluating the effect of three pre-electrophoresis DNA treatments on the outcome of Southern blot hybridization analysis using a Digoxigenin (DIG)-IGS fragment probe. Results showed that where DNA material is scarce, the use of undigested (native) fungal DNA not only saved time but it also gave better hybridization signal than predigestion treatments with EcoRV restriction enzyme. Hot water digestion of DNA prior electrophoresis and hybridization gave the least satisfactory result.
Control of Fusarium Crown and Root Rot of Tomato, Caused by Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici, by Grafting onto Resistant Rootstocks  [PDF]
Khaled Hibar,Mejda Daami-Remadi,Hayfa Jabnoun-Khiareddine,Mohamed El Mahjoub
Plant Pathology Journal , 2006,
Abstract: In this study, the efficacy of grafting two tomato cultivars onto two rootstocks was examined in growth chamber and in greenhouse conditions. The rootstock cultivars Beaufort F1 and He-Man F1, already known and confirmed as resistant to Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici, were evaluated during two crop seasons under greenhouse heated with geothermal water in South Tunisia. The cv. Durintha F1 showed the best plant growth, fruit yield and fruit quality when grafted onto Beaufort F1; while cv. Bochra F1 gave the best results when grafted onto He-Man F1. This study demonstrated that grafting tomato cultivars onto Fusarium resistant rootstocks is one of the best alternatives for controlling Fusarium crown and root rot of tomato.
La cohérence des comportements professionnels et privés chez les viticulteurs biologiques alsaciens The Coherence of Professional and Private Behaviours among Alsatian Organic Winegrowers  [cached]
Jean Nizet,Denise Van Dam,Marcus Dejardin
Recherches Sociologiques et Anthropologiques , 2011, DOI: 10.4000/rsa.346
Abstract: Cette contribution s’interroge sur la forte cohérence observée au niveau des comportements professionnels et privés d’un petit échantillon de viticulteurs alsaciens que nous avons interviewés longuement. On s’attache d’abord à décrire ces comportements et à identifier les principes à partir desquels les acteurs les justifient. On propose ensuite deux hypothèses susceptibles de rendre compte de la cohérence constatée. La première suggère que cette cohé-rence est en partie construite par le discours des interviewés. La seconde s’interroge sur les mécanismes de socialisation. Trois mécanismes sont iden-tifiés : les tensions identitaires que les personnes ressentent lorsqu’elles s’écar-tent des principes évoqués ; les contr les, formels et surtout informels, qu’elles exercent les unes sur les autres ; la hiérarchie qui s’instaure dans le champ de la viticulture biologique, en raison précisément de la plus ou moins forte cohé-rence des comportements. On montre que ces mécanismes combinent leurs effets pour produire une socialisation puissante et uniforme, qui fait des viti-culteurs biologiques interviewés des individus beaucoup plus intégrés que ce que prédisent des théories sociologiques qui mettent en avant la diversité, ou encore l’éclatement de l’expérience de l’individu contemporain. This contribution looks at the strong level of coherence observed in the behaviours, both professional and private, of a small sample of Alsatian winegrowers whom we interviewed at length. First there is an attempt at describing these behaviours and identifying the principles by which the actors justify them. We then propose two hypotheses liable to account for the coherence observed. The first suggests that this coherence is in part constructed out of the speech of the interviewees. The second asks about the socialization mechanisms. Three mechanisms are identified : the identitary tensions these people feel when they abandon the principles evoked ; the controls, formal and above all informal, that they exert on one another ; the hierarchy installed in the field of organic winegrowing, due precisely to this more or less reinforced coherence in behaviours. We show that these mechanisms combine their effects in producing a powerful and uniform socialization, which makes the organic winegrowers interviewed much more integrated individuals than what sociological theories advancing the diversity or, perhaps, the bursting forth of the experience of the contemporary individual, would have predicted.
évaluation environnementale de systèmes de production laitiers : comparaison des systèmes conventionnels et biologiques avec l'outil EDEN  [PDF]
Claver Kanyarushoki, Hayo van der Werf, Michael Corson et Fran?oise Roger
Sciences Eaux & Territoires : la Revue du IRSTEA , 2011,
Abstract: L'outil EDEN estime les impacts environnementaux ainsi que des impacts économiques et sociaux. Il a permis de faire des comparaisons entre les 47 fermes laitières pris en exemple dans l'étude confirmant sa pertinence à identifier les caractéristiques des fermes ayant le plus d'impact sur l'environnement.
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