oalib
Search Results: 1 - 10 of 100 matches for " "
All listed articles are free for downloading (OA Articles)
Page 1 /100
Display every page Item
Diagnóstico molecular de candidemia mediante PCR semianidada en pacientes críticos Molecular diagnosis of candidemia by seminested PCR in critically ill patients
William Pascual Ospina,Jorge Alberto Cortés
Acta Medica Colombiana , 2011,
Abstract: Objetivos: estandarizar una prueba molecular basada en PCR semianidada para el diagnóstico de candidemia Metodología: se desarrolló un estudio piloto en que se optimizó el protocolo de extracción y utilización de ADN ribosomal, amplificando la región ITS-2 completa de Candida spp. Y mediante PCR semianidada, reamplificando segmentos específicos de nueve especies clínicamente relevantes de Candida. Se utilizaron muestras clínicas de plasma de pacientes críticamente enfermos con candidemia documentada microbiológicamente del Hospital de la Samaritana en Bogotá. Se utilizó una muestra de candidemia simulada utilizando una cepa de Candida obtenida de orina. Resultados: se logró protocolizar dicha técnica y tener a partir de muestras clínicas de plasma una sensibilidad probable de 90% y especificidad teórica cercana a 100%. La capacidad de detección de este ensayo es hasta de una célula por 200 μl de plasma. Conclusiones: se estandarizó una prueba molecular para detección de candidemia en pacientes críticamente enfermos (Acta Med Colomb 2011; 36: 135-140). Objectives: to standardize a molecular test based on semi-nested PCR for diagnosis of candidemia. Methods: we developed a pilot study by means of optimizing the extraction protocol and use of ribosomal DNA, amplifying the complete ITS-2 region of Candida spp. And by semi-nested PCR reamplifying specific segments of nine clinically relevant Candida species. Clinical samples of plasma of critically ill patients with microbiologically proven candidemia from a third level hospital in Bogotá. Another sample of simulated candidemia was used with Candida strain form a urine sample. Results: we were able to standardize this technique and achieved from clinical samples of plasma a likely sensitivity of 90% and a theoretical specificity of 100%. The detection capability of this test is up to 1 cell per 200 μl of plasma. Conclusion: a molecular test for detection of candidemia among critically ill patients was standardized (Acta Med Colomb 2011; 36: 135-140).
Tipificación capsular mediante PCR de aislamientos de Haemophilus influenzae no tipificables por aglutinación PCR-based capsular typing of Haemophilus influenzae isolates non-typeable by agglutination
G. Weltman,M.S. Fossati,C. Correa,M. Regueira
Revista argentina de microbiolog?-a , 2005,
Abstract: Haemophilus influenzae es reconocido como un agente patógeno responsable de infecciones localizadas y sistémicas. Se han descrito 6 tipos de polisacáridos capsulares antigénicamente distintos (a, b, c, d, e, y f ) que se pueden identificar por aglutinación en lámina con antisueros específicos. También existen cepas no capsuladas (NC) fenotípicamente no tipificables (NT). La introducción de la vacuna conjugada produjo una marcada disminución de las enfermedades invasivas causadas por H. influenzae tipo b. En este contexto, la tipificación capsular mediante PCR es el método más apropiado para distinguir las cepas no capsuladas de las mutantes b deficientes en cápsula (b-) y detectar la presencia de cepas pertenecientes a otros serotipos que no puedan ser tipificables por aglutinación. Se determinó el genotipo capsular a 38 aislamientos de Haemophilus influenzae no tipificables por aglutinación, derivados al servicio de Bacteriología Clínica del INEI-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán" en el período 2002-2004. El 78,9% de los aislamientos provenían de hemocultivos y la mayor parte de ellos estaban asociados a foco respiratorio. El 100% de los aislamientos fueron identificados como H. influenzae no capsulados mediante la técnica de PCR. Haemophilus influenzae is recognized as a pathogenic agent responsible of localized and systemic infections. Six antigenically different capsular polysaccharide types have been described (a, b, c, d, e, and f ) which can be identified by slide agglutination with specific antisera. Besides there are non capsulated strains that cannot be typed by slide agglutination. The introduction of the conjugated vaccine produced an important reduction of invasive diseases caused by H. influenzae type b. Capsular typing by PCR is the most appropriated method for distinguishing non capsulated strains from capsule deficient type b mutants (b-) and for detecting strains of other serotypes that cannot be detected by slide agglutination. Capsular genotype was studied in 38 isolates of non-typeable Haemophilus influenzae received at INEIANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán" between 2002-2004. Of the isolates included in this study 78.9% of them were recovered from blood cultures and most of them were associated with a respiratory focus. By PCR technique 100% of the isolates were identified as non-capsulate H. influenzae and genotype b-was not detected.
IDENTIFICACIóN MEDIANTE PCR DEL SEXO DE LA PAPAYA (Carica papaya L.), HíBRIDO "POCOCí"  [cached]
Ericka Saalau-Rojas,Walter Barrantes-Santamaría,Carlos Luis Loría-Quirós,Arturo Brenes-Angulo
Agronomía Mesoamericana , 2009,
Abstract: El objetivo de la presente investigación fue identificar plantas hermafroditas del híbrido de papaya "Pococí". Para la identificación del sexo de las plantas del híbrido "Pococí", se utilizó el protocolo descrito por Deputy et al. (2002), con algunas modificaciones. Esta metodología emplea un PCR múltip le que permite la amplificación simultánea de dos fragmentos (1.300 y 800 pb respectivamente) para plantas hermafroditas y de un solo fragmento (1.300 pb) para plantas femeninas. El ADN se extrajo a partir de hojas de plantas de invernadero o campo con dos metodologías de extracción, CTAB y lisis alcalina (NaOH). La amplificación por PCR del ADN extraído de muestras foliares de papaya híbrido "Pococí", con ambos métodos de extracción, produjo los fragmentos del tama o esperado. La determinación del sexo de 1.500 plántulas en almácigo mostró un 46 % de plántulas hermafroditas y un 54 % de plantas femeninas. La proporción observada de plantas femeninas: hemafroditas no varió de la esperada (1:1) según la prueba de chi-cuadrado (p= 0,4237). Las plantas hermafroditas fueron llevadas al campo y al momento de la floración se determinó su sexo. La correspondencia entre el sexado por PCR y la expresión sexual en campo fue de un 98 %.
Detección y tipificación de virus del papiloma humano (VPH) mediante PCR- RFLP
Militza Quintero Vega,Jhon Fredy Cruz Gómez,Marco Bastidas,Lusmary Márquez
Revista de Obstetricia y Ginecología de Venezuela , 2008,
Abstract: Objetivo: Estandarizar una técnica de PCR-RFLP para la detección y tipificación de VPH en mujeres con diagnóstico clínico previo de infección por VPH. Método: Estudio descriptivo de corte transversal donde se procesaron 189 muestras del área genital de mujeres que acudieron para extracción de ADN, diagnóstico y tipificación por técnicas moleculares: PCR-RFLP. Ambiente: Facultad de Ciencias, Laboratorio de Biología y Medicina Experimental LABIOMEX, Universidad de Los Andes. Mérida, Estado Mérida, Venezuela. Resultados: La PCR-RFLP permitió detectar el virus y su identificación. El 16,8 % de las muestras presentó VPH de alto riesgo tipos 16, 31, 33, 35, 56, 59 y 68; el 6,8 % presentó VPH de riesgo intermedio tipos 51, 53, 58, 61 y 83; y el 18 % los tipos de bajo riesgo 6, 32, 53, 54, y 81. Conclusiones: La técnica PCR-RFLP estandarizada fue adecuada para el diagnóstico y la tipificación de VPH en muestras del área genital. El 51,9 % del total de las muestras resultaron positivas para VPH, siendo VPH 16 el subtipo de alto riesgo más común (20,0 %), y VPH 6 el de bajo riesgo más frecuente (23,8 %). Objective: To standardize a PCR-RFLP technique for detection and typification of HPV in women with clinical diagnostic of HPV infection. Method: Descriptive and transversal study with the assessment of 189 samples of the genital area of women that required DNA extraction, diagnostic and typification for PCR-RFLP molecular technique. Setting: Facultad de Ciencias, Laboratorio de Biologia y Medicina Experimental LABIOMEX, Universidad de Los Andes. Merida, Estado Merida, Venezuela. Results: The PCR-RFLP was able to detect and identify the virus. The 16.8 % of the samples presented HPV of high types 16, 31, 33, 35, 56, 59 and 68; the 6.8 % presented HPV of intermediate risk types 51, 53, 58, 61 and 83; and 18 % the low risk types 6, 32, 53, 54, and 81. Conclusions: The standardized PCR-RFLP technique was appropriate for the diagnostic and typification of HPV in samples from the genital area. The 51.9 % of samples were positive to HPV, been the more common (20 %) the HPV high risk subtype 16, and the low risk HPV 6 the more frequent (23.8%).
Detección y tipificación de virus del papiloma humano (VPH) mediante PCR- RFLP
Quintero Vega,Militza; Cruz Gómez,Jhon Fredy; Bastidas,Marco; Márquez,Lusmary; Puig Pons,Juan;
Revista de Obstetricia y Ginecología de Venezuela , 2008,
Abstract: objective: to standardize a pcr-rflp technique for detection and typification of hpv in women with clinical diagnostic of hpv infection. method: descriptive and transversal study with the assessment of 189 samples of the genital area of women that required dna extraction, diagnostic and typification for pcr-rflp molecular technique. setting: facultad de ciencias, laboratorio de biologia y medicina experimental labiomex, universidad de los andes. merida, estado merida, venezuela. results: the pcr-rflp was able to detect and identify the virus. the 16.8 % of the samples presented hpv of high types 16, 31, 33, 35, 56, 59 and 68; the 6.8 % presented hpv of intermediate risk types 51, 53, 58, 61 and 83; and 18 % the low risk types 6, 32, 53, 54, and 81. conclusions: the standardized pcr-rflp technique was appropriate for the diagnostic and typification of hpv in samples from the genital area. the 51.9 % of samples were positive to hpv, been the more common (20 %) the hpv high risk subtype 16, and the low risk hpv 6 the more frequent (23.8%).
Polimorfismo genético de beta-lactoglobulina y alphalactoalbúmina en el ganado criollo colombiano, mediante PCR-SSCP
Rosero-Alpala Jaime A.,Alvarez Franco Luz Angela,Mu?oz Florez Jaime Eduardo
Acta Agronómica , 2011,
Abstract: La población de ganado criollo colombiano ha venido presentando una inquietante disminución al pasar de 23.415 ejemplares en 1999 a 20.102 en 2003. A pesar de los esfuerzos por recuperar las razas criollas el panorama para su conservación es incierto, por tanto la búsqueda de caracteres deseables puede contribuir a su valoración y conservación. Los genes relacionados con el mejoramiento de la calidad de la leche producida por estas razas se consideran de gran importancia en la industria láctea, por tal razón y con el objetivo de caracterizar los genes beta-lactoglobulina y alpha-lactoalbúmina se analizaron 30 muestras de sangre de cada una de las razas criollas (Blanco Orejinegro, Caquete o, Casanare o, Coste o con cuernos, Chino Santandereano, Hartón del Valle, Romosinuano y Sanmartinero), dos razas sintéticas colombianas (Lucerna y Velásquez) y dos razas foráneas (Holstein y Brahman). Se amplificaron fragmentos de 262pb para beta-lactoglobulina (b-LG) y de 166 pb para alpha-lactoalbúmina (a-LA) que se genotipificaron mediante PCR-SSCP. El promedio de la frecuencia para b-LG A y b-LG B fue de 0.46 ± 0.020 y de 0.53 ± 0.020, respectivamente, y de 0.35 ± 0.019 para a-LA A y 0.64 ± 0.019 para a-LA B. El promedio de diversidad genética (He) para b-LG fue 0.498 y de 0.455 para a-LA. Los ganados criollos representan una base genética valiosa, como alternativa para mejorar genéticamente los hatos destinados a la producción de leche con mejores características en calidad para la industria láctea.
Rearreglos de genes de cadenas pesadas de las inmunoglobulinas en las gammapatías monoclonales Immunoglobulin heavy chain gene rearrangements in the monoclonal gammopathies  [cached]
Andrea Bosaleh,Valeria Denninghoff,Alejandro García,Carla Rescia
Medicina (Buenos Aires) , 2005,
Abstract: Las neoplasias de células plasmáticas resultan de la expansión de un clon de células B que secreta inmunoglobulinas, conocido como componente monoclonal o componente M. Las neoplasias malignas incluyen al mieloma múltiple y la macroglobulinemia de Waldenstr m, y la condición premaligna comprende las gammapatías monoclonales de significado incierto (MGUS). El MGUS presenta un componente monoclonal sin evidencia de mieloma múltiple, macroglobulinemia de Waldenstr m, amiloidosis primaria u otros desórdenes. El diagnóstico se basa en la combinación de características patológicas, radiológicas y clínicas. Aproximadamente el 25% de las gammapatías monoclonales de significado incierto desarrollarán mieloma múltiple, amiloidosis sistémica, macroglobulinemia o enfermedades linfoproliferativas malignas, indicando que sería una condición premielomatosa. El objetivo del presente trabajo es establecer la utilidad clínica de la inmunofenotipificación por citometría de flujo (CF) y la detección de clonalidad por biología molecular. Se estudiaron 32 pacientes, siete con diagnóstico de mieloma múltiple y veinticinco con gammapatía monoclonal en estudio, los cuales fueron divididos en cuatro grupos basados en los datos clínicos y los resultados de CF. En el grupo de pacientes con CF no diagnóstica, se realizó la detección de los rearreglos de los genes de las cadenas pesadas de las inmunoglobulinas mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR), detectándose monoclonalidad en el 59% de los casos. El estudio de los rearreglos de los genes de las cadenas pesadas de las IgH mediante PCR incrementa la sensibilidad de detección de monoclonalidad. Plasma cell neoplasia occurs as a result of the expansion of an immunoglobulin-secreting B-cells clones, known as monoclonal component or M component. Malignant neoplasias include multiple myeloma and Waldenstr m macroglobulinemia, while premalignant conditions comprise monoclonal gammopathies of unknown significance (MGUS). MGUS present a monoclonal component with no signs of multiple myeloma, Waldenstr m macroglobulinemia, primary amyloidosis or other disorders. Pathological, radiological and clinical features are required for the diagnosis. Approximately 25% of patients with MGUS will become multiple myeloma, primary amiloidosis, macroglobulinemia, or other lymphoproliferative disease, which would be a premyelomatous condition. The objective of this study was to determine the clinical implications of immunophenotyping by flow cytometry and of the detection of clonality by molecular biology. A total of 32 patients were studied.
Estudio mediante PCR múltiple de serotipos de Listeria monocytogenes aislados en Argentina
Callejo,R.; Prieto,M.; Martínez,C.; Aguerre,L.; Rocca,F.; Martínez,G.; Palmieri,O.;
Revista argentina de microbiolog?-a , 2008,
Abstract: a multiplex pcr assay, recently validated to characterize the serotypes of listeria monocytogenes was evaluated in comparison to conventional serotyping. three hundred forty two l. monocytogenes strains isolated from human, food, animal and environmental sources during the 1992-2005 period were assayed. the concordance between the two methods for serotypes 1/2a, 1/2b and 1/2c was 100%, whereas for serotype 4b it was 98%. serotyping is a useful tool for first line strain differentiation during epidemiological surveillance and outbreaks. the multiplex pcr assay offers a fast and low-cost alternative, which is easily adaptable to clinical bacteriology and bromatology laboratories.
Tipificación capsular mediante PCR de aislamientos de Haemophilus influenzae no tipificables por aglutinación
Weltman,G.; Fossati,M.S.; Correa,C.; Regueira,M.; Mollerach,M.;
Revista argentina de microbiolog?-a , 2005,
Abstract: haemophilus influenzae is recognized as a pathogenic agent responsible of localized and systemic infections. six antigenically different capsular polysaccharide types have been described (a, b, c, d, e, and f ) which can be identified by slide agglutination with specific antisera. besides there are non capsulated strains that cannot be typed by slide agglutination. the introduction of the conjugated vaccine produced an important reduction of invasive diseases caused by h. influenzae type b. capsular typing by pcr is the most appropriated method for distinguishing non capsulated strains from capsule deficient type b mutants (b-) and for detecting strains of other serotypes that cannot be detected by slide agglutination. capsular genotype was studied in 38 isolates of non-typeable haemophilus influenzae received at ineianlis "dr. carlos g. malbrán" between 2002-2004. of the isolates included in this study 78.9% of them were recovered from blood cultures and most of them were associated with a respiratory focus. by pcr technique 100% of the isolates were identified as non-capsulate h. influenzae and genotype b-was not detected.
Identificación de especies en productos de origen animal mediante pcr
Aranguren-Méndez,José; Portillo,María; Ruiz,Jorge; Villasmil-Ontiveros,Yenen; Yá?ez,Luis; Borjas,Lisbeth; Zabala,William;
Revista Científica , 2009,
Abstract: nowadays identification of animal-origin products (meat, milk and dairy products) is of paramount importance to costumers and specially as for species identification for a number of reasons: i) to avoid economic fraud for substitution or alteration of the product ; ii) to avoid health issues such as food allergies; iii) for culturals reasons. there for the value of analytic and sensitive identification tools such as dna fragments analysis, especially those of mitochondrial origin (12s rrna gene) because of its species-specific character. an identification methodology through amplification of a species-conserved region of 12s rrna gene (forward primer) and of a species-specific region of the same gene (reverse primer). template dna was extracted from biological samples of bovine, swine, ovine, caprine, equine and canine origin. after 1.5% agarose gel electrophoresis, fragments ranging from 150 to 364 bp were observed. results show that species could be easily identified through pcr in all cases and that this methodology could be a specific tool for determining the origin of animal products.
Page 1 /100
Display every page Item


Home
Copyright © 2008-2017 Open Access Library. All rights reserved.