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-  2015 

南京市成人星状病毒性腹泻病原基因特征分析
Genetic characteristics of astrovirus in adult outpatients with acute gastroenteritis, Nanjing

Keywords: 腹泻,病原学,星状病毒,荧光定量RT-PCR,RT-PCR

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摘要:目的 对2013年南京市疑似病毒性腹泻成人门诊样本进行星状病毒核酸检测、分子分型和进化分析,为星状病毒所致成人病毒性腹泻的分子流行病学提供资料。方法 收集2013年疑似病毒性腹泻门诊成人病例的腹泻物375份,用星状病毒特异性引物和探针进行荧光定量RT-PCR检测,然后对荧光定量RT-PCR阳性的样本,用一步法RT-PCR再进行星状病毒特异片段的检测。对RT-PCR产物进行双向测序和进化树分析。结果 荧光定量RT-PCR共检测到9例星状病毒阳性(2.4%),其中,6例(1.6%)扩增到单一条带,测序获得449 bp的星状病毒壳蛋白基因片段序列。经比对分析,6例星状病毒中,4例为5型星状病毒,1例为1型星状病毒,1例为8型星状病毒。结论 南京市星状病毒所致成人病毒性腹泻中有多种型别星状病毒,5型为优势型。

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