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核桃est-ssr标记的开发

, PP. 792-796

Keywords: 核桃,核桃楸,黑核桃,est,ssr标记

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?从genbank数据库上公布的5025条核桃(juglansregia)est序列中,用ssrhunter软件搜索到485条est序列中含有540个ssr,ssr出现频率为10.75%,ssr-ests检出率为9.7%。利用检出的ssr-ests序列设计ssr引物43对,对6个核桃样品、1个黑核桃(j.nigra)样品和1个核桃楸(j.mandshurica)样品进行了pcr扩增,其中40对引物有扩增带,占设计引物的93%,35对引物有多态性,占可扩增引物的87.5%。在有多态性的35对引物中,27对引物在核桃种内有多态性;8对引物在核桃种内无多态性,而在核桃、核桃楸和黑核桃种间有多态性。应用upgma方法对检测样品进行聚类分析,结果与传统分类一致。

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