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软件学报  2010 

Models and Algorithms for Alignment of Biological Networks
生物网络比对的模型与算法

Keywords: biological network,alignment,graph matching,constrained optimization,divide and conquer
生物网络
,比对,图的匹配,约束优化,分治策略

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生物网络比对是生物体结构、功能和进化分析的重要研究手段.首先给出了生物网络比对问题的形式化定义;其次重点分析了现有的比对模型和算法,按照比对方法的数学特性对其进行了分类,并对典型算法结合应用进行了深入探讨,对3类比对方法的特点进行了总结与比较;再次,分析归纳了生物网络比对软件,阐述了生物网络比对研究的意义和应用;最后指出了生物网络比对研究中的关键问题及生物网络比对未来的研究方向.

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